RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393193.6

NME1-NME2-202, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 1,021 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-202ENST00000393193 TSPAN1O60635 241 aa18.15■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 TFF2Q03403 129 aa18.15■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 HYIQ5T013 277 aa18.15■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 HAUS3Q68CZ6 603 aa18.15■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 CATSPER4Q7RTX7 472 aa18.15■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 KCNK18Q7Z418 384 aa18.15■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 KLHL23Q8NBE8 558 aa18.15■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 ERMNQ8TAM6 284 aa18.15■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 BSNDQ8WZ55 320 aa18.15■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 SNX21Q969T3 373 aa18.15■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 ASB2Q96Q27 587 aa18.15■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM105AQ9NUU6 356 aa18.15■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 H3BQV1 296 aa18.14■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 HOXA2O43364 376 aa18.14■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 CYP11B2P19099 503 aa18.14■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 CDC25AP30304 524 aa18.14■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP18.14■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 TIGD5Q53EQ6 642 aa18.14■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 TJAP1Q5JTD0 557 aa18.14■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 PADI6Q6TGC4 694 aa18.14■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa18.14■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 MCPH1Q8NEM0 835 aa18.14■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 COG5Q9UP83 839 aa18.14■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 B4GALT3O60512 393 aa18.13■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 BMP1P13497 986 aa18.13■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 RAB27AP51159 221 aa18.13■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 PTPROQ16827 1216 aa18.13■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 TCEAL5Q5H9L2 206 aa18.13■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 AGMOQ6ZNB7 445 aa18.13■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 BRAPQ7Z569 592 aa18.13■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 LRRC43Q8N309 656 aa18.13■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 HELQQ8TDG4 1101 aa18.13■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 SNX29Q8TEQ0 813 aa18.13■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 LPPQ93052 612 aa18.13■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 PNMA5Q96PV4 448 aa18.13■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 KIAA1024Q9UPX6 916 aa18.13■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 TRIP11Q15643 1979 aa18.13■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 INPPL1O15357 1258 aa18.12■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 EDN1P05305 212 aa18.12■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 SYT1P21579 422 aa18.12■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 IRS1P35568 1242 aa18.12■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 RESTQ13127 1097 aa18.12■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 CTC1Q2NKJ3 1217 aa18.12■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 DTHD1Q6ZMT9 781 aa18.12■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa18.12■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 DAW1Q8N136 415 aa18.12■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 LRRC15Q8TF66 581 aa18.12■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 CCDC113Q9H0I3 377 aa18.12■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 BHMT2Q9H2M3 363 aa18.12■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa18.12■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 TTLL13PA6NNM8 815 aa18.11■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 E9PMD0 336 aa18.11■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 DLL1O00548 723 aa18.11■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 FSCN2O14926 492 aa18.11■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 B4GALT5O43286 388 aa18.11■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 OFD1O75665 1012 aa18.11■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 EYA4O95677 639 aa18.11■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 LAG3P18627 525 aa18.11■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 AXLP30530 894 aa18.11■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 LTBRP36941 435 aa18.11■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 KCNQ1P51787 676 aa18.11■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 HYAL1Q12794 435 aa18.11■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 MAPK7Q13164 816 aa18.11■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 TFDP1Q14186 410 aa18.11■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM187BQ17R55 369 aa18.11■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 RSPH1Q8WYR4 309 aa18.11■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 HLA-CQ95604 372 aa18.11■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 RAB34Q9BZG1 259 aa18.11■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 FZD8Q9H461 694 aa18.11■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 MTMR6Q9Y217 621 aa18.11■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 STK24Q9Y6E0 443 aa18.11■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 ARHGEF35A5YM69 484 aa18.1■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 FGF18O76093 207 aa18.1■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 SKIP12755 728 aa18.1■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 NCLP19338 710 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 PLCB3Q01970 1234 aa18.1■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 UBE3AQ05086 875 aa18.1■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 GRIN1Q05586 938 aa18.1■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 PTPAQ15257 358 aa18.1■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 TMEM119Q4V9L6 283 aa18.1■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 KCNT2Q6UVM3 1135 aa18.1■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 SLC39A11Q8N1S5 342 aa18.1■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 POF1BQ8WVV4 589 aa18.1■□□□□ 0.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 CCDC51Q96ER9 411 aa18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms