RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 ABI1Q8IZP0 508 aa22.89■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 RNF169Q8NCN4 708 aa22.89■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM105AQ9NUU6 356 aa22.89■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 HCSTQ9UBK5 93 aa22.89■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 LRWD1Q9UFC0 647 aa22.89■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa22.89■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 BMP1P13497 986 aa22.88■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 PRPHP41219 470 aa22.88■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 RAB27AP51159 221 aa22.88■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 TFDP1Q14186 410 aa22.88■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 LRRC43Q8N309 656 aa22.88■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.88■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 RAB34Q9BZG1 259 aa22.88■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 STK24Q9Y6E0 443 aa22.88■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 LAG3P18627 525 aa22.87■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 GLRA2P23416 452 aa22.87■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 DNAJB1P25685 340 aa22.87■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 CAPSQ13938 189 aa22.87■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 ECM1Q16610 540 aa22.87■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.87■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa22.87■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 MCPH1Q8NEM0 835 aa22.87■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 RSPH1Q8WYR4 309 aa22.87■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 NFKBIZQ9BYH8 718 aa22.87■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 KCNQ1P51787 676 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 UBE3AQ05086 875 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 COL19A1Q14993 1142 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 IL17AQ16552 155 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 HELQQ8TDG4 1101 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 POF1BQ8WVV4 589 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 PADI6Q6TGC4 694 aa22.85■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 GPRC5CQ9NQ84 441 aa22.85■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa22.85■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 BDP1A6H8Y1 2624 aa22.85■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 ARHGEF35A5YM69 484 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 FGF18O76093 207 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 ERLIN2O94905 339 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 CYP11B2P19099 503 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 AXLP30530 894 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 MBTD1Q05BQ5 628 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 UBXN11Q5T124 520 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 KCNT2Q6UVM3 1135 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 MAEAQ7L5Y9 396 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 LPPQ93052 612 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 MEIS3P2A8K0S8 358 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 NCK2O43639 380 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 TSPAN1O60635 241 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 PLCB3Q01970 1234 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 AMHR2Q16671 573 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 THNSL1Q8IYQ7 743 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 PGBD4Q96DM1 585 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2E3-201ENST00000392415 PP2D1A8MPX8 630 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 CSPG5O95196 566 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 KCNA5P22460 613 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 IRS1P35568 1242 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 HYAL1Q12794 435 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 LONRF3Q496Y0 759 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 KRT79Q5XKE5 535 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 NOTUMQ6P988 496 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 GLB1LQ6UWU2 654 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC51Q96ER9 411 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF558Q96NG5 402 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 BHMT2Q9H2M3 363 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 LZTS1Q9Y250 596 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 OFD1O75665 1012 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 CDC25AP30304 524 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 PPM1AP35813 382 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 CTC1Q2NKJ3 1217 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 LEXMQ3ZCV2 418 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 AGMOQ6ZNB7 445 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 BRAPQ7Z569 592 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 CNNM3Q8NE01 707 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 TLR9Q9NR96 1032 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.81■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 PDCP20941 246 aa22.81■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 PBX3P40426 434 aa22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms