RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 SLFN11Q7Z7L1 901 aa14.27□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 NT5DC3Q86UY8 548 aa14.27□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 FMNL3Q8IVF7 1028 aa14.27□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 SLC35G2Q8TBE7 412 aa14.27□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa14.27□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 AMACRQ9UHK6 382 aa14.27□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 NENFQ9UMX5 172 aa14.27□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 H0YIN7 160 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 SCTRP47872 440 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 SLC15A2Q16348 729 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 MAEAQ7L5Y9 396 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 EGFL6Q8IUX8 553 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC50Q8IVM0 306 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 SLC5A5Q92911 643 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 SCN9AQ15858 1988 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC188H7C350 402 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 EXOC3O60645 756 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 CLSTN1O94985 981 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 ARP10275 920 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 TNFAIP3P21580 790 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 ACCSLQ4AC99 568 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 CEP55Q53EZ4 464 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC26Q8TAB7 109 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 SLC30A5Q8TAD4 765 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 MAGEC3Q8TD91 643 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP14.26□□□□□ -0.137e-7■■■■■ 39.4
TMOD1-202ENST00000375175 MKNK1Q9BUB5 465 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 UNC45AQ9H3U1 944 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 EHMT1Q9H9B1 1298 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 GOPCQ9HD26 462 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 SEL1LQ9UBV2 794 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 CLRN2A0PK11 232 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 ARHGEF35A5YM69 484 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 GMNCA6NCL1 334 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 TMOD1P28289 359 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 HSD17B3P37058 310 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 NPEPPSP55786 919 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 LRRC45Q96CN5 670 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 TMOD2Q9NZR1 351 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 PKD2L1Q9P0L9 805 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 TTI1O43156 1089 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 DAPK3O43293 454 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 MYL7Q01449 175 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 NFIL3Q16649 462 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 OR2W6PQ8NHA6 318 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 TBC1D31Q96DN5 1066 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 HOOK2Q96ED9 719 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 HES6Q96HZ4 224 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 TMBIM4Q9HC24 238 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 ATRNL1Q5VV63 1379 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 FRMPD4Q14CM0 1322 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 LRRN2O75325 713 aa14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 FGGP02679 453 aa14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM253P0C7T8 217 aa14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 MYZAPP0CAP1 466 aa14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 ECHS1P30084 290 aa14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 RASGEF1CQ8N431 466 aa14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 CHURC1Q8WUH1 139 aa14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 RFFLQ8WZ73 363 aa14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 SEC16BQ96JE7 1060 aa14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 FIZ1Q96SL8 496 aa14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 LXNQ9BS40 222 aa14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 TEKT3Q9BXF9 490 aa14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 WDR11Q9BZH6 1224 aa14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 NEUROG2Q9H2A3 272 aa14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 DPH5Q9H2P9 285 aa14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 APEX2Q9UBZ4 518 aa14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 TMX2Q9Y320 296 aa14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 ATP8B3O60423 1300 aa14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 TRAPPC3O43617 180 aa14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 HIP1RO75146 1068 aa14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 CHRNA5P30532 468 aa14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 SLC8A1P32418 973 aa14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 CEP120Q8N960 986 aa14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 TRIM31Q9BZY9 425 aa14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 PCIF1Q9H4Z3 704 aa14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms