RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370287.7

CSAG1-202, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAG1, Length 875 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-202ENST00000370287 RUSC1Q9BVN2 902 aa16.56■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 DNM3Q9UQ16 869 aa16.56■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa16.56■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 LRRIQ4A6NIV6 560 aa16.55■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa16.55■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 TSPAN1O60635 241 aa16.55■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 BMPR1AP36894 532 aa16.55■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 LONRF3Q496Y0 759 aa16.55■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 CLLU1OSQ5K130 101 aa16.55■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 UBXN11Q5T124 520 aa16.55■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 LPPQ93052 612 aa16.55■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 CPB2Q96IY4 423 aa16.55■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 AK8Q96MA6 479 aa16.55■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 CASD1Q96PB1 797 aa16.55■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 DACT1Q9NYF0 836 aa16.55■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 MYH15Q9Y2K3 1946 aa16.55■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 REV3LO60673 3130 aa16.54■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 MEIS3P2A8K0S8 358 aa16.54■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 C5orf67F2Z3F1 127 aa16.54■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 H3BNC9 293 aa16.54■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 B4GALT5O43286 388 aa16.54■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 ERLIN2O94905 339 aa16.54■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 LONP1P36776 959 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 GPM6BQ13491 265 aa16.54■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 SPECC1Q5M775 1068 aa16.54■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 RINT1Q6NUQ1 792 aa16.54■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 DAW1Q8N136 415 aa16.54■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 HELQQ8TDG4 1101 aa16.54■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 CLIC6Q96NY7 704 aa16.54■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 KIFC3Q9BVG8 833 aa16.54■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 TRAIPQ9BWF2 469 aa16.54■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 NFKBIZQ9BYH8 718 aa16.54■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM117Q9H0C3 514 aa16.54■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 NT5C3AQ9H0P0 336 aa16.54■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 CSRNP2Q9H175 543 aa16.54■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 PRDM6Q9NQX0 595 aa16.54■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 FAM105AQ9NUU6 356 aa16.54■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 HIP1RO75146 1068 aa16.53■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 EDN1P05305 212 aa16.53■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 MAPK7Q13164 816 aa16.53■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 KARSQ15046 597 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 LRRC55Q6ZSA7 311 aa16.53■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 C1orf186Q6ZWK4 172 aa16.53■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 USP49Q70CQ1 688 aa16.53■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa16.53■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 CWH43Q9H720 699 aa16.53■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 RWDD3Q9Y3V2 267 aa16.53■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 TTLL13PA6NNM8 815 aa16.52■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 EOMESO95936 686 aa16.52■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 F13A1P00488 732 aa16.52■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP16.52■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 PLA2G4BP0C869 781 aa16.52■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 PLCG1P19174 1290 aa16.52■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 UBA7P41226 1012 aa16.52■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 NAMPTP43490 491 aa16.52■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 NASPP49321 788 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 SLC12A3P55017 1021 aa16.52■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 EPSTI1Q96J88 318 aa16.52■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa16.52■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
CSAG1-202ENST00000370287 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa16.51■□□□□ 0.23
CSAG1-202ENST00000370287 GRM6O15303 877 aa16.51■□□□□ 0.23
CSAG1-202ENST00000370287 HOXA2O43364 376 aa16.51■□□□□ 0.23
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF623O75123 536 aa16.51■□□□□ 0.23
CSAG1-202ENST00000370287 CSPG5O95196 566 aa16.51■□□□□ 0.23
CSAG1-202ENST00000370287 RB1P06400 928 aa16.51■□□□□ 0.23
CSAG1-202ENST00000370287 AXLP30530 894 aa16.51■□□□□ 0.23
CSAG1-202ENST00000370287 RAB27AP51159 221 aa16.51■□□□□ 0.23
CSAG1-202ENST00000370287 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa16.51■□□□□ 0.23
CSAG1-202ENST00000370287 SLC39A14Q15043 492 aa16.51■□□□□ 0.23
CSAG1-202ENST00000370287 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP16.51■□□□□ 0.23
CSAG1-202ENST00000370287 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
CSAG1-202ENST00000370287 NOTUMQ6P988 496 aa16.51■□□□□ 0.23
CSAG1-202ENST00000370287 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
CSAG1-202ENST00000370287 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa16.51■□□□□ 0.23
CSAG1-202ENST00000370287 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa16.51■□□□□ 0.23
CSAG1-202ENST00000370287 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
CSAG1-202ENST00000370287 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
CSAG1-202ENST00000370287 KIFAP3Q92845 792 aa16.51■□□□□ 0.23
CSAG1-202ENST00000370287 CALML4Q96GE6 196 aa16.51■□□□□ 0.23
CSAG1-202ENST00000370287 CCDC113Q9H0I3 377 aa16.51■□□□□ 0.23
CSAG1-202ENST00000370287 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa16.51■□□□□ 0.23
CSAG1-202ENST00000370287 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
CSAG1-202ENST00000370287 USP20Q9Y2K6 914 aa16.51■□□□□ 0.23
CSAG1-202ENST00000370287 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa16.5■□□□□ 0.23
CSAG1-202ENST00000370287 SLC26A4O43511 780 aa16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms