RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 BICD1Q96G01 975 aa19.51■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 UNC93B1Q9H1C4 597 aa19.51■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 VPS16Q9H269 839 aa19.51■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 TMEM206Q9H813 350 aa19.51■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 INTS13Q9NVM9 706 aa19.51■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 NRCAMQ92823 1304 aa19.51■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 ANKRD63C9JTQ0 380 aa19.51■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 NBPF20Q3BBV1 942 aa19.51■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 CCDC40Q4G0X9 1142 aa19.51■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 FAM47CQ5HY64 1035 aa19.51■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 CEP135Q66GS9 1140 aa19.51■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa19.51■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 HVCN1Q96D96 273 aa19.51■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP19.51■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 PCIF1Q9H4Z3 704 aa19.51■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 C17orf102A2RUQ5 167 aa19.5■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 H0YCG3 227 aa19.5■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 PES1O00541 588 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 CETN3O15182 167 aa19.5■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 CYP2C9P11712 490 aa19.5■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 CASP4P49662 377 aa19.5■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 COPB1P53618 953 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 NKX3-2P78367 333 aa19.5■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 TMEM62Q0P6H9 643 aa19.5■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 FOXR2Q6PJQ5 311 aa19.5■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 DRC7Q8IY82 874 aa19.5■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 CEP63Q96MT8 703 aa19.5■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 SCLT1Q96NL6 688 aa19.5■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 MAP7D2Q96T17 732 aa19.5■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 EXOC7Q9UPT5 735 aa19.5■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa19.49■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 TREHO43280 583 aa19.49■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 CBFA2T2O43439 604 aa19.49■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 EDN1P05305 212 aa19.49■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 TMOD1P28289 359 aa19.49■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 STRN3Q13033 797 aa19.49■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 TFDP1Q14186 410 aa19.49■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa19.49■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 LHX8Q68G74 356 aa19.49■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 RNF180Q86T96 592 aa19.49■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa19.49■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 PDLIM2Q96JY6 352 aa19.49■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 CBWD1Q9BRT8 395 aa19.49■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa19.49■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 K7ERI5 159 aa19.48■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 CST5P28325 142 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 MTFR1Q15390 333 aa19.48■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 SLC39A4Q6P5W5 647 aa19.48■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa19.48■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa19.48■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 SIP14410 1827 aa19.48■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 PCNTO95613 3336 aa19.48■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 A0A087WZ62 844 aa19.48■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 N4BP3O15049 544 aa19.48■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 MSCO60682 206 aa19.48■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 RPL13P26373 211 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 ARMCX5Q6P1M9 558 aa19.48■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 GOLGA5Q8TBA6 731 aa19.48■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 VTI1AQ96AJ9 217 aa19.48■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 PPP1R9BQ96SB3 815 aa19.48■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa19.48■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 KCNG1Q9UIX4 513 aa19.48■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 FRMPD3Q5JV73 1810 aa19.47■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 A0A1B0GTH6 734 aa19.47■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 TEX33O43247 280 aa19.47■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 AKAP3O75969 853 aa19.47■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 LIG4P49917 911 aa19.47■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa19.47■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa19.47■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 NLRP7Q8WX94 980 aa19.47■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 CCDC113Q9H0I3 377 aa19.47■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 GINS2Q9Y248 185 aa19.47■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 EVPLQ92817 2033 aa19.47■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 GOLGA8IPA6NC78 632 aa19.46■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 GOLGA8JA6NMD2 632 aa19.46■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 TTLL13PA6NNM8 815 aa19.46■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa19.46■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 ASAP2O43150 1006 aa19.46■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 PRKCBP05771 671 aa19.46■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 PHKA2P46019 1235 aa19.46■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 ACLYP53396 1101 aa19.46■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 ADAM17P78536 824 aa19.46■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 KIZQ2M2Z5 673 aa19.46■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 FILIP1LQ4L180 1135 aa19.46■□□□□ 0.71
LTV1-201ENST00000367576 TMC6Q7Z403 805 aa19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.8 ms