RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 KRT71Q3SY84 523 aa23.25■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 CHURC1Q8WUH1 139 aa23.25■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 STRA6Q9BX79 667 aa23.25■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 TMX2Q9Y320 296 aa23.25■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 AFF2P51816 1311 aa23.25■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 LRRN2O75325 713 aa23.25■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 ARP10275 920 aa23.25■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 HADHBP55084 474 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 LMO3Q8TAP4 145 aa23.25■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 KAT2BQ92831 832 aa23.25■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa23.25■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 DUPD1Q68J44 220 aa23.24■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 ATP8B4Q8TF62 1192 aa23.24■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM206Q9H813 350 aa23.24■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 COG5Q9UP83 839 aa23.24■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 ALG6Q9Y672 507 aa23.24■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 CAPN7Q9Y6W3 813 aa23.24■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa23.24■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 TRAPPC3O43617 180 aa23.23■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 FSBPO95073 299 aa23.23■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 PALB2Q86YC2 1186 aa23.23■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 UBL4BQ8N7F7 174 aa23.23■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 CYFIP2Q96F07 1278 aa23.23■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 RASAL2Q9UJF2 1139 aa23.23■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 NRXN2Q9P2S2 1712 aa23.23■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 PFASO15067 1338 aa23.23■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 K7ENM7 598 aa23.23■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 MMP10P09238 476 aa23.23■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 CDR1P51861 262 aa23.23■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 NEK9Q8TD19 979 aa23.23■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 ACER1Q8TDN7 264 aa23.23■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa23.23■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 H0YHG0 523 aa23.22■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 P4HA2O15460 535 aa23.22■■□□□ 1.31
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PTDSS1-201ENST00000337004 HSPA6P17066 643 aa23.22■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 DRG2P55039 364 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa23.22■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 C11orf63Q6NUN7 778 aa23.22■■□□□ 1.31
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PTDSS1-201ENST00000337004 BANK1Q8NDB2 785 aa23.22■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 RIT2Q99578 217 aa23.22■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 TXLNGYQ9BZA5 131 aa23.22■■□□□ 1.31
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PTDSS1-201ENST00000337004 EMSYQ7Z589 1322 aa23.22■■□□□ 1.31
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PTDSS1-201ENST00000337004 TMOD1P28289 359 aa23.22■■□□□ 1.31
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PTDSS1-201ENST00000337004 PADI6Q6TGC4 694 aa23.22■■□□□ 1.31
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PTDSS1-201ENST00000337004 PSMD1Q99460 953 aa23.22■■□□□ 1.31
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PTDSS1-201ENST00000337004 VCAM1P19320 739 aa23.21■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 VAMP7P51809 220 aa23.21■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 IFT88Q13099 833 aa23.21■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 TCEAL1Q15170 157 aa23.21■■□□□ 1.31
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PTDSS1-201ENST00000337004 DAW1Q8N136 415 aa23.21■■□□□ 1.31
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PTDSS1-201ENST00000337004 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa23.21■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 USP8P40818 1118 aa23.21■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 GPC5P78333 572 aa23.21■■□□□ 1.31
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PTDSS1-201ENST00000337004 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
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PTDSS1-201ENST00000337004 DLG4P78352 724 aa23.2■■□□□ 1.3
PTDSS1-201ENST00000337004 ARMC9Q7Z3E5 817 aa23.2■■□□□ 1.3
PTDSS1-201ENST00000337004 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
PTDSS1-201ENST00000337004 MXRA8Q9BRK3 442 aa23.2■■□□□ 1.3
PTDSS1-201ENST00000337004 PCIF1Q9H4Z3 704 aa23.2■■□□□ 1.3
PTDSS1-201ENST00000337004 TMOD2Q9NZR1 351 aa23.2■■□□□ 1.3
PTDSS1-201ENST00000337004 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
PTDSS1-201ENST00000337004 CHRNA3P32297 505 aa23.2■■□□□ 1.3
PTDSS1-201ENST00000337004 FNTAP49354 379 aa23.2■■□□□ 1.3
PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM174Q8WUU8 243 aa23.2■■□□□ 1.3
PTDSS1-201ENST00000337004 ACCSQ96QU6 501 aa23.2■■□□□ 1.3
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