RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336070.11

FRMD1-202, Transcript of FERM domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene FRMD1, Length 1,600 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD1-202ENST00000336070 ADAM9Q13443 819 aa20.09■□□□□ 0.81
FRMD1-202ENST00000336070 CAPSQ13938 189 aa20.09■□□□□ 0.81
FRMD1-202ENST00000336070 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
FRMD1-202ENST00000336070 RHPN2Q8IUC4 686 aa20.09■□□□□ 0.81
FRMD1-202ENST00000336070 SLC9A9Q8IVB4 645 aa20.09■□□□□ 0.81
FRMD1-202ENST00000336070 C12orf56Q8IXR9 622 aa20.09■□□□□ 0.81
FRMD1-202ENST00000336070 SH3TC2Q8TF17 1288 aa20.09■□□□□ 0.81
FRMD1-202ENST00000336070 TRIM5Q9C035 493 aa20.09■□□□□ 0.81
FRMD1-202ENST00000336070 ARID2Q68CP9 1835 aa20.08■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 SERPINC1P01008 464 aa20.08■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 TPM3P06753 285 aa20.08■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 CLCN3P51790 818 aa20.08■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 FANCCQ00597 558 aa20.08■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 TCP11X2Q5H9J9 407 aa20.08■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa20.08■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa20.08■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 NME8Q8N427 588 aa20.08■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 RNF149Q8NC42 400 aa20.08■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa20.08■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 HDAC6Q9UBN7 1215 aa20.08■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 CEP350Q5VT06 3117 aa20.07■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 CBFA2T2O43439 604 aa20.07■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 ATP1A3P13637 1013 aa20.07■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 NR2F2P24468 414 aa20.07■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 ACLYP53396 1101 aa20.07■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 CHMP4BP1P59074 171 aa20.07■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 PTENP60484 403 aa20.07■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 NBPF20Q3BBV1 942 aa20.07■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 TAF2Q6P1X5 1199 aa20.07■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 LRRC55Q6ZSA7 311 aa20.07■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 ZNF410Q86VK4 478 aa20.07■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 IRF2BP1Q8IU81 584 aa20.07■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.07■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa20.07■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 KCNJ18B7U540 433 aa20.06■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa20.06■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 MARSP56192 900 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 KCNJ12Q14500 433 aa20.06■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa20.06■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 GLT1D1Q96MS3 346 aa20.06■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 KIFC3Q9BVG8 833 aa20.06■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa20.06■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 AKT3Q9Y243 479 aa20.06■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa20.06■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 ADCY5O95622 1261 aa20.05■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 PIGRP01833 764 aa20.05■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 NR3C1P04150 777 aa20.05■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 CYP2C9P11712 490 aa20.05■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 PHKA2P46019 1235 aa20.05■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 UBASH3AP57075 661 aa20.05■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 MAPK6Q16659 721 aa20.05■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 FILIP1LQ4L180 1135 aa20.05■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 MKNK1Q9BUB5 465 aa20.05■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 DMAC2Q9NW81 257 aa20.05■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 AP5Z1O43299 807 aa20.05■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 TPM2P07951 284 aa20.05■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 SLFN12LQ6IEE8 588 aa20.05■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 TAS1R3Q7RTX0 852 aa20.05■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 KSR1Q8IVT5 923 aa20.05■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.05■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 ZPBP2Q6X784 338 aa20.04■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 FRMD5Q7Z6J6 570 aa20.04■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 FZD8Q9H461 694 aa20.04■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 IFT122Q9HBG6 1241 aa20.04■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 MYH11P35749 1972 aa20.03■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 KBTBD13C9JR72 458 aa20.03■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 TREHO43280 583 aa20.03■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 GARTP22102 1010 aa20.03■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 GPC3P51654 580 aa20.03■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 ZNF75DP51815 510 aa20.03■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 ITGA7Q13683 1181 aa20.03■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 FAM187BQ17R55 369 aa20.03■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa20.03■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa20.03■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 RPAINQ86UA6 219 aa20.03■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 VTI1AQ96AJ9 217 aa20.03■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 PRIMPOLQ96LW4 560 aa20.03■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 NLRP4Q96MN2 994 aa20.03■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.03■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 RNF208Q9H0X6 261 aa20.03■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 IFNKQ9P0W0 207 aa20.03■□□□□ 0.8
FRMD1-202ENST00000336070 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms