RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 MYMKA6NI61 221 aa29.56■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC169A6NNP5 214 aa29.56■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 SFI1A8K8P3 1242 aa29.56■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa29.56■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 SLFN14P0C7P3 912 aa29.56■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 TPRNQ4KMQ1 711 aa29.56■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 SPIRE2Q8WWL2 714 aa29.56■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 MINDY3Q9H8M7 445 aa29.56■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 DENND3A2RUS2 1198 aa29.55■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 TBCAO75347 108 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 FAM13AO94988 1023 aa29.55■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 AMHP03971 560 aa29.55■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 FGFR4P22455 802 aa29.55■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 NPTX2P47972 431 aa29.55■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 NDUFA8P51970 172 aa29.55■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 CLEC17AQ6ZS10 378 aa29.55■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 DYMQ7RTS9 669 aa29.55■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 SLC9A7Q96T83 725 aa29.55■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 PARVGQ9HBI0 331 aa29.55■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 KMT5AQ9NQR1 393 aa29.55■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa29.55■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa29.55■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 ERLIN2O94905 339 aa29.54■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 AXLP30530 894 aa29.54■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF131P52739 623 aa29.54■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 MBTD1Q05BQ5 628 aa29.54■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 MYCT1Q8N699 235 aa29.54■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM87AQ8NBN3 555 aa29.54■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 ADAM2Q99965 735 aa29.54■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 RGS18Q9NS28 235 aa29.54■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 C1orf112Q9NSG2 853 aa29.54■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 DACT1Q9NYF0 836 aa29.54■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 SERTAD1Q9UHV2 236 aa29.54■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 H0YCG3 227 aa29.53■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 DSC3Q14574 896 aa29.53■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 MAPK6Q16659 721 aa29.53■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 LRIT3Q3SXY7 679 aa29.53■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 DNAJC19Q96DA6 116 aa29.53■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 PRIMPOLQ96LW4 560 aa29.53■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 K7ERI5 159 aa29.52■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 SCP2P22307 547 aa29.52■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 FAM187BQ17R55 369 aa29.52■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP29.52■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 SLC24A5Q71RS6 500 aa29.52■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 FZD8Q9H461 694 aa29.52■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 ZHX3Q9H4I2 956 aa29.52■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM134Q9H6X4 195 aa29.52■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF202O95125 648 aa29.51■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 GAP43P17677 238 aa29.51■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 LONRF3Q496Y0 759 aa29.51■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 CNNM4Q6P4Q7 775 aa29.51■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa29.51■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 SLC17A8Q8NDX2 589 aa29.51■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 STAMQ92783 540 aa29.51■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 C7orf25Q9BPX7 421 aa29.51■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa29.51■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa29.51■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 SEL1LQ9UBV2 794 aa29.51■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 PTPRSQ13332 1948 aa29.51■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 MGEA5O60502 916 aa29.5■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 MYOCDQ8IZQ8 938 aa29.5■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 TOP1MTQ969P6 601 aa29.5■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC34Q96HJ3 373 aa29.5■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 TRIM9Q9C026 710 aa29.5■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa29.5■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa29.49■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 SLC16A4O15374 487 aa29.49■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 TRAK2O60296 914 aa29.49■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 IDEP14735 1019 aa29.49■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 ABCD1P33897 745 aa29.49■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 DEFB103AP81534 67 aa29.49■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC65Q8IXS2 484 aa29.49■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 LINC01599Q8WXQ3 324 aa29.49■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 KIFC3Q9BVG8 833 aa29.49■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 TRAIPQ9BWF2 469 aa29.49■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC113Q9H0I3 377 aa29.49■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa29.49■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 ACKR2O00590 384 aa29.48■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 TSPAN1O60635 241 aa29.48■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 PRKCBP05771 671 aa29.48■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 MYL1P05976 194 aa29.48■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 STAG3L1P0CL83 205 aa29.48■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 AFMP43652 599 aa29.48■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 SARSP49591 514 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 NCKAP1LP55160 1127 aa29.48■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 FAM189BP81408 668 aa29.48■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 AMHR2Q16671 573 aa29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms