RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 MYBL1P10243 752 aa25.71■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 NPR1P16066 1061 aa25.71■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 FOXN1O15353 648 aa25.71■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 RUBCNQ92622 972 aa25.71■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 GGPS1O95749 300 aa25.71■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 SMARCA1P28370 1054 aa25.71■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 ICA1LQ8NDH6 482 aa25.7■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 VSNL1P62760 191 aa25.7■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 GRM4Q14833 912 aa25.7■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 NCAPHQ15003 741 aa25.7■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 ANO5Q75V66 913 aa25.7■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 NUDCD3Q8IVD9 361 aa25.7■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa25.7■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 USP17L15C9J2P7 530 aa25.7■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 USP17L13C9JLJ4 530 aa25.7■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 USP17L11C9JVI0 530 aa25.7■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 USP17L18D6R9N7 530 aa25.7■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 USP17L22D6RA61 530 aa25.7■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 USP17L17D6RBQ6 530 aa25.7■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 USP17L19D6RCP7 530 aa25.7■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 USP17L20D6RJB6 530 aa25.7■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 USP17L24Q0WX57 530 aa25.7■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 USP17L6PQ6QN14 398 aa25.7■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 MCPH1Q8NEM0 835 aa25.7■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 ADA2Q9NZK5 511 aa25.7■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 NLRP1Q9C000 1473 aa25.7■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 CCNYL1Q8N7R7 359 aa25.7■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF341Q9BYN7 854 aa25.7■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 CFAP69A5D8W1 941 aa25.69■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 PP2D1A8MPX8 630 aa25.69■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 MTF1Q14872 753 aa25.69■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP25.69■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 CLEC17AQ6ZS10 378 aa25.69■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 EP400NLQ6ZTU2 488 aa25.69■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 SPATA4Q8NEY3 305 aa25.69■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 GRAMD1AQ96CP6 724 aa25.69■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 F8W8V4 182 aa25.69■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 RMDN2Q96LZ7 410 aa25.69■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM20AQ96MK3 541 aa25.69■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 POLD4Q9HCU8 107 aa25.69■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 PCSK1NQ9UHG2 260 aa25.69■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.69■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 RAD17O75943 681 aa25.69■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 GNA15P30679 374 aa25.69■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 GPC3P51654 580 aa25.69■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 ROR1Q01973 937 aa25.69■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 IZUMO3Q5VZ72 239 aa25.69■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP11CQ8NB49 1132 aa25.69■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 C1orf54Q8WWF1 131 aa25.69■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa25.68■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 GH2P01242 217 aa25.68■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 CIITAP33076 1130 aa25.68■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 KIAA1841Q6NSI8 718 aa25.68■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 OLFM3Q96PB7 478 aa25.68■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC13A1Q9BZW2 595 aa25.68■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 ABCB11O95342 1321 aa25.68■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 F5H423 210 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 FGFR4P22455 802 aa25.68■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 TTC8Q8TAM2 541 aa25.68■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 COA1Q9GZY4 146 aa25.68■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP4F11Q9HBI6 524 aa25.68■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 POTEFA5A3E0 1075 aa25.68■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 POTEIP0CG38 1075 aa25.68■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 TNFAIP2Q03169 654 aa25.68■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 POTEGQ6S5H5 508 aa25.68■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 POTEEQ6S8J3 1075 aa25.68■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 RHOT1Q8IXI2 618 aa25.68■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 RFFLQ8WZ73 363 aa25.68■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC1Q9BTT6 524 aa25.68■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.68■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 NAALADL2Q58DX5 795 aa25.68■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 EDEM3Q9BZQ6 932 aa25.68■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 ERBB3P21860 1342 aa25.68■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 USP17L10C9JJH3 530 aa25.67■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 M0QYV0 167 aa25.67■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 ANP32DO95626 131 aa25.67■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 IGKV5-2P06315 115 aa25.67■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 SNX19Q92543 992 aa25.67■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 BARHL2Q9NY43 387 aa25.67■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 HADHAP40939 763 aa25.67■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC26A7Q8TE54 656 aa25.67■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNF1Q9H3M0 494 aa25.67■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKARQ7Z5J8 1434 aa25.67■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT7P08729 469 aa25.67■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT17Q04695 432 aa25.67■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 GLYCTKQ8IVS8 523 aa25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms