RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 NARSO43776 548 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 GALTP07902 379 aa8.9□□□□□ -0.98
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PGGT1B-201ENST00000296642 CREMQ03060 361 aa8.9□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 AP3B2Q13367 1082 aa8.9□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 NOMO2Q5JPE7 1267 aa8.9□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 CLLU1OSQ5K130 101 aa8.9□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 ABHD15Q6UXT9 468 aa8.9□□□□□ -0.98
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PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
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PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM175Q9BSA9 504 aa8.9□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAIPQ9BWF2 469 aa8.9□□□□□ -0.98
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PGGT1B-201ENST00000296642 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 FAN1Q9Y2M0 1017 aa8.9□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 SAMM50Q9Y512 469 aa8.9□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa8.9□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
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PGGT1B-201ENST00000296642 INPPL1O15357 1258 aa8.89□□□□□ -0.99
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PGGT1B-201ENST00000296642 AK2P54819 239 aa8.89□□□□□ -0.99
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PGGT1B-201ENST00000296642 STARD6P59095 220 aa8.89□□□□□ -0.99
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PGGT1B-201ENST00000296642 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE2SQ16763 222 aa8.89□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 KANK3Q6NY19 840 aa8.89□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP1R18Q6NYC8 613 aa8.89□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 PLA2G4DQ86XP0 818 aa8.89□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 LNPKQ9C0E8 428 aa8.89□□□□□ -0.99
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PGGT1B-201ENST00000296642 LY9Q9HBG7 655 aa8.89□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 UBN1Q9NPG3 1134 aa8.89□□□□□ -0.99
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PGGT1B-201ENST00000296642 RNF19AQ9NV58 838 aa8.89□□□□□ -0.99
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PGGT1B-201ENST00000296642 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa8.89□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 DCHS1Q96JQ0 3298 aa8.89□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa8.88□□□□□ -0.99
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PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM87BQ96K49 555 aa8.88□□□□□ -0.99
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PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF577Q9BSK1 485 aa8.88□□□□□ -0.99
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PGGT1B-201ENST00000296642 EVPLQ92817 2033 aa8.87□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 DCDC2BA2VCK2 349 aa8.87□□□□□ -0.99
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PGGT1B-201ENST00000296642 SREBF1P36956 1147 aa8.87□□□□□ -0.99
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PGGT1B-201ENST00000296642 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 PPM1JQ5JR12 505 aa8.87□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 IL31Q6EBC2 164 aa8.87□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 CATSPER4Q7RTX7 472 aa8.87□□□□□ -0.99
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