RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 F13A1P00488 732 aa27.66■■■□□ 2.02
CXCL2-201ENST00000296031 FGFR1P11362 822 aa27.66■■■□□ 2.02
CXCL2-201ENST00000296031 PKP1Q13835 747 aa27.66■■■□□ 2.02
CXCL2-201ENST00000296031 FBXO22Q8NEZ5 403 aa27.66■■■□□ 2.02
CXCL2-201ENST00000296031 KIFAP3Q92845 792 aa27.66■■■□□ 2.02
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
CXCL2-201ENST00000296031 KIAA1671Q9BY89 1806 aa27.66■■■□□ 2.02
CXCL2-201ENST00000296031 TBKBP1A7MCY6 615 aa27.65■■■□□ 2.02
CXCL2-201ENST00000296031 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP27.65■■■□□ 2.02
CXCL2-201ENST00000296031 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
CXCL2-201ENST00000296031 NASPP49321 788 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
CXCL2-201ENST00000296031 MBTD1Q05BQ5 628 aa27.65■■■□□ 2.02
CXCL2-201ENST00000296031 EPC2Q52LR7 807 aa27.65■■■□□ 2.02
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM192Q8IY95 271 aa27.65■■■□□ 2.02
CXCL2-201ENST00000296031 RASSF8Q8NHQ8 419 aa27.65■■■□□ 2.02
CXCL2-201ENST00000296031 BSNDQ8WZ55 320 aa27.65■■■□□ 2.02
CXCL2-201ENST00000296031 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
CXCL2-201ENST00000296031 EYSQ5T1H1 3165 aa27.65■■■□□ 2.02
CXCL2-201ENST00000296031 EOMESO95936 686 aa27.64■■■□□ 2.02
CXCL2-201ENST00000296031 CTNNB1P35222 781 aa27.64■■■□□ 2.02
CXCL2-201ENST00000296031 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
CXCL2-201ENST00000296031 BECN1Q14457 450 aa27.64■■■□□ 2.02
CXCL2-201ENST00000296031 RINT1Q6NUQ1 792 aa27.64■■■□□ 2.02
CXCL2-201ENST00000296031 C1orf186Q6ZWK4 172 aa27.64■■■□□ 2.02
CXCL2-201ENST00000296031 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
CXCL2-201ENST00000296031 RUSC1Q9BVN2 902 aa27.64■■■□□ 2.02
CXCL2-201ENST00000296031 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
CXCL2-201ENST00000296031 HOXA2O43364 376 aa27.63■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 TSPAN1O60635 241 aa27.63■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 LINC00271P0C7V0 271 aa27.63■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 PLA2G4BP0C869 781 aa27.63■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 SKIP12755 728 aa27.63■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 NAMPTP43490 491 aa27.63■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 KARSQ15046 597 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 PPP2R5AQ15172 486 aa27.63■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 SPECC1Q5M775 1068 aa27.63■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa27.63■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 EPSTI1Q96J88 318 aa27.63■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 IFT74Q96LB3 600 aa27.63■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 CLIC6Q96NY7 704 aa27.63■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 CCSER1Q9C0I3 900 aa27.63■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 FAM105AQ9NUU6 356 aa27.63■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 AXLP30530 894 aa27.62■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 SLC12A3P55017 1021 aa27.62■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 STK38Q15208 465 aa27.62■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 AMHR2Q16671 573 aa27.62■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 MICALL1Q8N3F8 863 aa27.62■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 LINC00301Q8NCQ3 95 aa27.62■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 CPB2Q96IY4 423 aa27.62■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 C2orf40Q9H1Z8 148 aa27.62■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 RNF19AQ9NV58 838 aa27.62■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 RWDD3Q9Y3V2 267 aa27.62■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 LPXNO60711 386 aa27.61■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF623O75123 536 aa27.61■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 HIP1RO75146 1068 aa27.61■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 PLCG1P19174 1290 aa27.61■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 GUCY2CP25092 1073 aa27.61■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 BMPR1AP36894 532 aa27.61■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 RAB27AP51159 221 aa27.61■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 LONRF3Q496Y0 759 aa27.61■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 USP49Q70CQ1 688 aa27.61■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 ABI1Q8IZP0 508 aa27.61■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 DEPTORQ8TB45 409 aa27.61■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 PPM1EQ8WY54 764 aa27.61■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 TIPINQ9BVW5 301 aa27.61■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM117Q9H0C3 514 aa27.61■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 NOTUMQ6P988 496 aa27.6■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 DAW1Q8N136 415 aa27.6■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 LPPQ93052 612 aa27.6■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 DRC1Q96MC2 740 aa27.6■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 KCND2Q9NZV8 630 aa27.6■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa27.6■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 MTCH2Q9Y6C9 303 aa27.6■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 MYH11P35749 1972 aa27.59■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 SPTLC2O15270 562 aa27.59■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 B4GALT5O43286 388 aa27.59■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 YEATS4O95619 227 aa27.59■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 RB1P06400 928 aa27.59■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa27.59■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 GPM6BQ13491 265 aa27.59■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 CLLU1OSQ5K130 101 aa27.59■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 UBXN11Q5T124 520 aa27.59■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 HELQQ8TDG4 1101 aa27.59■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 LRRC15Q8TF66 581 aa27.59■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC51Q96ER9 411 aa27.59■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 CASD1Q96PB1 797 aa27.59■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 KIFC3Q9BVG8 833 aa27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms