RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259154.8

KCTD3-201, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCTD3, Length 3,931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3-201ENST00000259154 FERP16591 822 aa15.94■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 MAPK4P31152 587 aa15.94■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 MAN1A1P33908 653 aa15.94■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 BARGINQ6ZT62 677 aa15.94■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 OGFOD1Q8N543 542 aa15.94■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 PAF1Q8N7H5 531 aa15.94■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 CCDC89Q8N998 374 aa15.94■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 BTBD6Q96KE9 485 aa15.94■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 SEMA6BQ9H3T3 888 aa15.94■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 TMBIM4Q9HC24 238 aa15.94■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 TXLNGQ9NUQ3 528 aa15.94■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa15.94■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 APBA3O96018 575 aa15.94■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 SLC30A5Q8TAD4 765 aa15.94■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 MORC4Q8TE76 937 aa15.94■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 FAM161BQ96MY7 647 aa15.94■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 SGK1O00141 431 aa15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 GNAT1P11488 350 aa15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 SERPINB4P48594 390 aa15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 ZNF844Q08AG5 666 aa15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 PDXDC2PQ6P474 469 aa15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 ANKRD35Q8N283 1001 aa15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 SLC35G2Q8TBE7 412 aa15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 C18orf8Q96DM3 657 aa15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 CYP4F11Q9HBI6 524 aa15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 LMNB1P20700 586 aa15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 BRD2P25440 801 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 WDR78Q5VTH9 848 aa15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 CLEC4GQ6UXB4 293 aa15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 CROCCP2Q86T23 111 aa15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 SPATA24Q86W54 205 aa15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 AGAP11Q8TF27 550 aa15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 ISCUQ9H1K1 167 aa15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 VCX3BQ9H321 246 aa15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 I3L4J1 428 aa15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 SHBGP04278 402 aa15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 PLS3P13797 630 aa15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 FLT3P36888 993 aa15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 RASA3Q14644 834 aa15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 CRYMQ14894 314 aa15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 EPC2Q52LR7 807 aa15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 AADACL2Q6P093 401 aa15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 NPHS2Q9NP85 383 aa15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 TRPC6Q9Y210 931 aa15.93■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 PIAS1O75925 651 aa15.92■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 UCHL3P15374 230 aa15.92■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 SAT1P21673 171 aa15.92■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 STRN3Q13033 797 aa15.92■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 TRIM59Q8IWR1 403 aa15.92■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 PARD3BQ8TEW8 1205 aa15.92■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 FAM53CQ9NYF3 392 aa15.92■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa15.92■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 MAPK13O15264 365 aa15.92■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 CLDN3O15551 220 aa15.92■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 TEKT4Q8WW24 435 aa15.92■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 TXNDC16Q9P2K2 825 aa15.92■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa15.92■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 CHD4Q14839 1912 aa15.92■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa15.92■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 A8MUI8 341 aa15.92■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 GAS7O60861 476 aa15.92■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 RPS6KA4O75676 772 aa15.92■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 CACNB3P54284 484 aa15.92■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 ATG4AQ8WYN0 398 aa15.92■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa15.92■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 ZFP69BQ9UJL9 534 aa15.92■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa15.92■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 RASSF10A6NK89 507 aa15.91■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 F5H423 210 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 JAMLQ86YT9 394 aa15.91■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 ANLNQ9NQW6 1124 aa15.91■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 GINM1Q9NU53 330 aa15.91■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 RHBDL2Q9NX52 303 aa15.91■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 STK17AQ9UEE5 414 aa15.91■□□□□ 0.14
KCTD3-201ENST00000259154 ANAPC7Q9UJX3 599 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms