RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 RFFLQ8WZ73 363 aa22.92■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRPC6Q9Y210 931 aa22.92■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 C6orf229H3BNL8 230 aa22.92■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 CHMP2AO43633 222 aa22.92■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 DIAPH2O60879 1101 aa22.92■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 SEPT2Q15019 361 aa22.92■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 ECT2Q9H8V3 914 aa22.92■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.92■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.92■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 PPATQ06203 517 aa22.92■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 MAPK7Q13164 816 aa22.92■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 MESDQ14696 234 aa22.92■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC30A5Q8TAD4 765 aa22.92■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.92■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.92■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 ALG6Q9Y672 507 aa22.92■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.91■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 TGFB1I1O43294 461 aa22.91■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 SOX5P35711 763 aa22.91■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 NCALDP61601 193 aa22.91■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 ANO3Q9BYT9 981 aa22.91■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa22.91■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.91■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 LDHCP07864 332 aa22.91■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 KRT16P08779 473 aa22.91■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC8A1P32418 973 aa22.91■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 KCNK9Q9NPC2 374 aa22.91■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 DNM3Q9UQ16 869 aa22.91■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 SBF2Q86WG5 1849 aa22.9■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCDC189A1A4V9 331 aa22.9■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 RARAP10276 462 aa22.9■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 GHRP10912 638 aa22.9■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 VCAM1P19320 739 aa22.9■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 PTGIRP43119 386 aa22.9■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 SNX1Q13596 522 aa22.9■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 AUHQ13825 339 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.9■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.9■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCDC50Q8IVM0 306 aa22.9■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM186BQ8IYM0 893 aa22.9■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 GPR88Q9GZN0 384 aa22.9■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 TBK1Q9UHD2 729 aa22.9■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa22.9■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 TISP43B9A030 160 aa22.9■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 PEX19P40855 299 aa22.9■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 CNGA2Q16280 664 aa22.9■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 HYIQ5T013 277 aa22.9■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 ERICH1Q86X53 443 aa22.9■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM167BQ9BTA0 163 aa22.9■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.9■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.89■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCDC169A6NNP5 214 aa22.89■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 TNFAIP3P21580 790 aa22.89■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.89■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 EXOC3L1Q86VI1 746 aa22.89■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 CD209Q9NNX6 404 aa22.89■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 KCNMB3Q9NPA1 279 aa22.89■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM86B1E9PN63 330 aa22.89■■□□□ 1.25
CSNK1G2-201ENST00000255641 EML1O00423 815 aa22.89■■□□□ 1.25
CSNK1G2-201ENST00000255641 RASGRF2O14827 1237 aa22.89■■□□□ 1.25
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.89■■□□□ 1.25
CSNK1G2-201ENST00000255641 FERP16591 822 aa22.89■■□□□ 1.25
CSNK1G2-201ENST00000255641 VPS41P49754 854 aa22.89■■□□□ 1.25
CSNK1G2-201ENST00000255641 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.89■■□□□ 1.25
CSNK1G2-201ENST00000255641 NUGGCQ68CJ6 796 aa22.89■■□□□ 1.25
CSNK1G2-201ENST00000255641 NSMFQ6X4W1 530 aa22.89■■□□□ 1.25
CSNK1G2-201ENST00000255641 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.89■■□□□ 1.25
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF570Q96NI8 536 aa22.89■■□□□ 1.25
CSNK1G2-201ENST00000255641 POLLQ9UGP5 575 aa22.89■■□□□ 1.25
CSNK1G2-201ENST00000255641 NAV1Q8NEY1 1877 aa22.89■■□□□ 1.25
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZBTB5O15062 677 aa22.88■■□□□ 1.25
CSNK1G2-201ENST00000255641 NUDT17P0C025 328 aa22.88■■□□□ 1.25
CSNK1G2-201ENST00000255641 MYBL1P10243 752 aa22.88■■□□□ 1.25
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.88■■□□□ 1.25
CSNK1G2-201ENST00000255641 KAT5Q92993 513 aa22.88■■□□□ 1.25
CSNK1G2-201ENST00000255641 CALCAP01258 141 aa22.88■■□□□ 1.25
CSNK1G2-201ENST00000255641 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CSNK1G2-201ENST00000255641 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa22.88■■□□□ 1.25
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCDC105Q8IYK2 499 aa22.88■■□□□ 1.25
CSNK1G2-201ENST00000255641 MYCT1Q8N699 235 aa22.88■■□□□ 1.25
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM118BQ9BPY3 351 aa22.88■■□□□ 1.25
CSNK1G2-201ENST00000255641 RIPK2O43353 540 aa22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms