RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254667.7

PTPRE-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type E, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRE, Length 5,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRE-201ENST00000254667 NR1H3Q13133 447 aa20.26■□□□□ 0.83
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PTPRE-201ENST00000254667 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa20.25■□□□□ 0.83
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PTPRE-201ENST00000254667 ACSL3O95573 720 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRE-201ENST00000254667 TXNP10599 105 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PTPRE-201ENST00000254667 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
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PTPRE-201ENST00000254667 MAGEB5Q9BZ81 275 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRE-201ENST00000254667 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
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