RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000251303.10

SLX1A-201, Transcript of SLX1 homolog A, structure-specific endonuclease subunit, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLX1A, Length 1,091 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1A-201ENST00000251303 PSMD10O75832 226 aa21.37■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 STBD1O95210 358 aa21.37■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 RAB27AP51159 221 aa21.37■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 USP11P51784 963 aa21.37■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 FGD1P98174 961 aa21.37■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 LONRF3Q496Y0 759 aa21.37■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 XKR3Q5GH77 459 aa21.37■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 FRMD5Q7Z6J6 570 aa21.37■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 GPR149Q86SP6 731 aa21.37■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 GJA10Q969M2 543 aa21.37■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 DNAJB4Q9UDY4 337 aa21.37■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa21.37■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 C2orf16Q68DN1 1984 aa21.37■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 SPTBN4Q9H254 2564 aa21.36■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 B4GALT3O60512 393 aa21.36■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 ZNF623O75123 536 aa21.36■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 OFD1O75665 1012 aa21.36■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 CPA1P15085 419 aa21.36■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 SLC11A1P49279 550 aa21.36■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 B3GNT9Q6UX72 402 aa21.36■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 Q6ZUG5 572 aa21.36■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 CCDC149Q6ZUS6 474 aa21.36■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 MIER3Q7Z3K6 550 aa21.36■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 BRF1Q92994 677 aa21.36■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 AOC1P19801 751 aa21.35■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 DNM2P50570 870 aa21.35■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 CLCN4P51793 760 aa21.35■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 NTRK3Q16288 839 aa21.35■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 OTOP3Q7RTS5 596 aa21.35■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 FLCNQ8NFG4 579 aa21.35■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 SH2D3AQ9BRG2 576 aa21.35■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 GBP3Q9H0R5 595 aa21.35■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 VPS54Q9P1Q0 977 aa21.35■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 DUSP12Q9UNI6 340 aa21.35■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 MAFO75444 373 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 NPR3P17342 541 aa21.34■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 TDGQ13569 410 aa21.34■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 Q4G0T1 1027 aa21.34■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 CATSPER4Q7RTX7 472 aa21.34■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 ZNF280BQ86YH2 543 aa21.34■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 RHPN2Q8IUC4 686 aa21.34■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 KLHL5Q96PQ7 755 aa21.34■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa21.34■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 STK39Q9UEW8 545 aa21.34■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 FAM186AA6NE01 2351 aa21.33■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 DCHS1Q96JQ0 3298 aa21.33■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 PI15O43692 258 aa21.33■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa21.33■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 KSR1Q8IVT5 923 aa21.33■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 CCDC105Q8IYK2 499 aa21.33■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 TBCKQ8TEA7 893 aa21.33■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 PGBD4Q96DM1 585 aa21.33■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 KCNK12Q9HB15 430 aa21.33■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa21.33■■□□□ 1.01
SLX1A-201ENST00000251303 SPDYE4A6NLX3 237 aa21.32■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 LILRB3O75022 631 aa21.32■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 CNPP09543 421 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 KLRC2P26717 231 aa21.32■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 LETM2Q2VYF4 491 aa21.32■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 AGMOQ6ZNB7 445 aa21.32■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 FBXL16Q8N461 479 aa21.32■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 URGCPQ8TCY9 931 aa21.32■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 KCNB2Q92953 911 aa21.32■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 NLRP4Q96MN2 994 aa21.32■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.32■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 AGXT2Q9BYV1 514 aa21.32■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 IFT122Q9HBG6 1241 aa21.32■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 SH3GLB2Q9NR46 395 aa21.32■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa21.32■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa21.31■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 DDHD2O94830 711 aa21.31■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 TDP2O95551 362 aa21.31■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP21.31■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 IFNAR1P17181 557 aa21.31■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 CYP3A7P24462 503 aa21.31■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 ANO5Q75V66 913 aa21.31■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 ADSSL1Q8N142 457 aa21.31■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 RTP3Q9BQQ7 232 aa21.31■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 TMEM175Q9BSA9 504 aa21.31■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.3■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 ANGPT1Q15389 498 aa21.3■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 SIX5Q8N196 739 aa21.3■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 ETNPPLQ8TBG4 499 aa21.3■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 MBOAT7Q96N66 472 aa21.3■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.3■■□□□ 1
SLX1A-201ENST00000251303 RSAD1Q9HA92 442 aa21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms