RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249377.4

LRRC17-201, Transcript of leucine rich repeat containing 17, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC17, Length 2,002 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17-201ENST00000249377 FAXDC2Q96IV6 333 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 SGIP1Q9BQI5 828 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 SEMA4AQ9H3S1 761 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 DNM3Q9UQ16 869 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 TLDC2A0PJX2 215 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 ANKRD62A6NC57 917 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 USP17L10C9JJH3 530 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 PODXLO00592 558 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 TBX3O15119 743 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 TGFB1I1O43294 461 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 SNX3O60493 162 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 RPL21P46778 160 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 GRAPQ13588 217 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 TCEAL1Q15170 157 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 GALNTL6Q49A17 601 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 C11orf63Q6NUN7 778 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 BANK1Q8NDB2 785 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 ERMNQ8TAM6 284 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 TCP11Q8WWU5 503 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 C18orf8Q96DM3 657 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 ANO3Q9BYT9 981 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 COG5Q9UP83 839 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 AGAP1Q9UPQ3 857 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 STK24Q9Y6E0 443 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 RIPK2O43353 540 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 RARGP13631 454 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 ABCB4P21439 1286 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 PDE6CP51160 858 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 EIF6P56537 245 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 AUHQ13825 339 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 SLMAPQ14BN4 828 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 CLEC10AQ8IUN9 316 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 PRELID2Q8N945 189 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 TBC1D31Q96DN5 1066 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 UIMC1Q96RL1 719 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 THAP2Q9H0W7 228 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 CD209Q9NNX6 404 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 OLFML3Q9NRN5 406 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 ABCF3Q9NUQ8 709 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 NRXN2Q9P2S2 1712 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 DNAJC12Q9UKB3 198 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 CCDC189A1A4V9 331 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 RSPH10B2B2RC85 870 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 USP17L15C9J2P7 530 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 USP17L13C9JLJ4 530 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 USP17L11C9JVI0 530 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 USP17L18D6R9N7 530 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 USP17L22D6RA61 530 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 USP17L17D6RBQ6 530 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 USP17L19D6RCP7 530 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 USP17L20D6RJB6 530 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 CLIC2O15247 247 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 GGPS1O95749 300 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 VIMP08670 466 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 RSPH10BP0C881 870 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 RARAP10276 462 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 IL1R1P14778 569 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 NQO1P15559 274 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 FMO5P49326 533 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 ZNF131P52739 623 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 NCALDP61601 193 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 USP17L24Q0WX57 530 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 ZNF568Q3ZCX4 644 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 USP17L6PQ6QN14 398 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 TAOK1Q7L7X3 1001 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 SLF2Q8IX21 1173 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 RHOT2Q8IXI1 618 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 MKNK1Q9BUB5 465 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 C15orf41Q9Y2V0 281 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 MEIS1O00470 390 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 RASGRF2O14827 1237 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 UBOX5O94941 541 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 GCNT3O95395 438 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 CLTAP09496 248 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 KRT13P13646 458 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 KCNA1Q09470 495 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 AP3B2Q13367 1082 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 KIF22Q14807 665 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 CYP1B1Q16678 543 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms