RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233330.6

RTKN-201, Transcript of rhotekin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RTKN, Length 2,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKN-201ENST00000233330 H2AFZP0C0S5 128 aa21.41■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 NPTX2P47972 431 aa21.41■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa21.41■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 C1orf220Q5T0J3 134 aa21.41■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 H2AFVQ71UI9 128 aa21.41■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 OTUD6AQ7L8S5 288 aa21.41■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 ATP6V0A1Q93050 837 aa21.41■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 CDHR1Q96JP9 859 aa21.41■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 LRRC1Q9BTT6 524 aa21.41■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 P4HA2O15460 535 aa21.41■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 STAM2O75886 525 aa21.41■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 SMTNP53814 917 aa21.41■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 SH3D19Q5HYK7 790 aa21.41■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 LRRC57Q8N9N7 239 aa21.41■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 PLEKHO2Q8TD55 490 aa21.41■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 HVCN1Q96D96 273 aa21.41■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 CEP170P1Q96L14 293 aa21.41■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 MAF1Q9H063 256 aa21.41■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 TBX20Q9UMR3 447 aa21.41■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 TELO2Q9Y4R8 837 aa21.41■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 CCDC169A6NNP5 214 aa21.4■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 PRKG1Q13976 671 aa21.4■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 EPC2Q52LR7 807 aa21.4■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 MAP4K3Q8IVH8 894 aa21.4■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 RUBCNQ92622 972 aa21.4■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 KIFC3Q9BVG8 833 aa21.4■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 EXOC7Q9UPT5 735 aa21.4■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 H3BQF6 201 aa21.4■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 PSAPP07602 524 aa21.4■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 CCDC172P0C7W6 258 aa21.4■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 LMNB1P20700 586 aa21.4■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.021e-11■□□□□ 10.8
RTKN-201ENST00000233330 NOP2P46087 812 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 DNA2P51530 1060 aa21.4■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 CETN1Q12798 172 aa21.4■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 GLYCTKQ8IVS8 523 aa21.4■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 BSNDQ8WZ55 320 aa21.4■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 KIFAP3Q92845 792 aa21.4■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 PDE11AQ9HCR9 933 aa21.4■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 SLC9A2Q9UBY0 812 aa21.4■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 SBF1O95248 1867 aa21.39■■□□□ 1.02
RTKN-201ENST00000233330 USP2O75604 605 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 MYBL2P10244 700 aa21.39■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 ADSSP30520 456 aa21.39■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 GCLMP48507 274 aa21.39■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 ARHGAP44Q17R89 818 aa21.39■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 SWSAP1Q6NVH7 229 aa21.39■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 TPCN2Q8NHX9 752 aa21.39■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 FBXO41Q8TF61 875 aa21.39■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 HDAC7Q8WUI4 952 aa21.39■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 SPIRE2Q8WWL2 714 aa21.39■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 C17orf75Q9HAS0 396 aa21.39■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa21.39■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa21.39■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 ANKRD63C9JTQ0 380 aa21.39■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 ADRB2P07550 413 aa21.39■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 GPS2Q13227 327 aa21.39■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 GNPTABQ3T906 1256 aa21.39■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 KMT5AQ9NQR1 393 aa21.39■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.39■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 PFASO15067 1338 aa21.38■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 OTOFQ9HC10 1997 aa21.38■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 A0A0G2JMZ2 1700 aa21.38■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 DENND3A2RUS2 1198 aa21.38■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 GALCP54803 685 aa21.38■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 ACTR2P61160 394 aa21.38■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 FAM193AP78312 1265 aa21.38■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 KIF22Q14807 665 aa21.38■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 GOLGA8IPA6NC78 632 aa21.37■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 GOLGA8JA6NMD2 632 aa21.37■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 CES2O00748 559 aa21.37■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 PMM2O15305 246 aa21.37■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 LRRN2O75325 713 aa21.37■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 CNGA1P29973 690 aa21.37■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 SOX10P56693 466 aa21.37■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 SP4Q02446 784 aa21.37■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 RPS6KA1Q15418 735 aa21.37■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 ABHD15Q6UXT9 468 aa21.37■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 ARHGEF19Q8IW93 802 aa21.37■■□□□ 1.01
RTKN-201ENST00000233330 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
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