RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 RABGGTAQ92696 567 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 CPB2Q96IY4 423 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 CTAGE1Q96RT6 745 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 PACSIN1Q9BY11 444 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 HSPBP1Q9NZL4 362 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 GCNT4Q9P109 453 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 HDAC6Q9UBN7 1215 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 K7ERI5 159 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 GUCY2FP51841 1108 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 GSDMDP57764 484 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 GHRHRQ02643 423 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 ORC1Q13415 861 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 CAPSQ13938 189 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF394Q53GI3 561 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 XKR3Q5GH77 459 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 EFCAB12Q6NXP0 572 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 PALB2Q86YC2 1186 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 REXO1L1PQ8IX06 675 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 MROH8Q9H579 483 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 TBX20Q9UMR3 447 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 SIK3Q9Y2K2 1263 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 PTPRJQ12913 1337 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 MYPNQ86TC9 1320 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 ZBTB42B2RXF5 422 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 H3BRB1 525 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 BUB1O43683 1085 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 GFPT2O94808 682 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 FLT3LGP49771 235 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 ARHGAP1Q07960 439 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 PSMD2Q13200 908 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 ACVR2BQ13705 512 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF792Q3KQV3 632 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 FAM182AQ5T1J6 154 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 TAF3Q5VWG9 929 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 EEF1DP3Q658K8 133 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 CXCL17Q6UXB2 119 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 LRRC27Q9C0I9 530 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 PLCB1Q9NQ66 1216 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 OLFML3Q9NRN5 406 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 AKT3Q9Y243 479 aa7.19□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 DNAH14Q0VDD8 3507 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 A0A087WZ62 844 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 SRGAP2O75044 1071 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 URI1O94763 535 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 SFNP31947 248 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 CCNA1P78396 465 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 PPP2R3AQ06190 1150 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 TTLL4Q14679 1199 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 OTUD6AQ7L8S5 288 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 OR8K1Q8NGG5 319 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 SCFD2Q8WU76 684 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 SPAG5Q96R06 1193 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 IWS1Q96ST2 819 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 APOL6Q9BWW8 343 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 LGALS2P05162 132 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 GUCY2CP25092 1073 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 CXCR5P32302 372 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF131P52739 623 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 PRKCZQ05513 592 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 NEDD9Q14511 834 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 FAM47CQ5HY64 1035 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 LLGL2Q6P1M3 1020 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 CCDC150Q8NCX0 1101 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 NEK11Q8NG66 645 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 DEPTORQ8TB45 409 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 DEF6Q9H4E7 631 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 IMPACTQ9P2X3 320 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 AKR1B10O60218 316 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 OFD1O75665 1012 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 CTSHP09668 335 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 EXOC3L4Q17RC7 722 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 NIPA1Q7RTP0 329 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 PPM1KQ8N3J5 372 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 OR6J1Q8NGC5 347 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 TAS1R2Q8TE23 839 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 SEMA4DQ92854 862 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 RNF186Q9NXI6 227 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 SALL4Q9UJQ4 1053 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 ADGRG1Q9Y653 693 aa7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 PDXKO00764 312 aa7.17□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 DGAT1O75907 488 aa7.17□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 EPB41P11171 864 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 LIG4P49917 911 aa7.17□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 FAM110CQ1W6H9 321 aa7.17□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms