RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000040877.1

TARBP1-201, Transcript of TAR (HIV-1) RNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TARBP1, Length 5,130 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP1-201ENST00000040877 CEP120Q8N960 986 aa24.75■■□□□ 1.55
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TARBP1-201ENST00000040877 ATG16L1Q676U5 607 aa24.74■■□□□ 1.55
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TARBP1-201ENST00000040877 DIP2AQ14689 1571 aa24.72■■□□□ 1.55
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TARBP1-201ENST00000040877 M0QYV0 167 aa24.72■■□□□ 1.55
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TARBP1-201ENST00000040877 MAGEB5Q9BZ81 275 aa24.7■■□□□ 1.55
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TARBP1-201ENST00000040877 NFU1Q9UMS0 254 aa24.7■■□□□ 1.55
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TARBP1-201ENST00000040877 TAC1P20366 129 aa24.7■■□□□ 1.54
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TARBP1-201ENST00000040877 EMSYQ7Z589 1322 aa24.69■■□□□ 1.54
TARBP1-201ENST00000040877 IFT88Q13099 833 aa24.69■■□□□ 1.54
TARBP1-201ENST00000040877 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
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TARBP1-201ENST00000040877 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
TARBP1-201ENST00000040877 PASD1Q8IV76 773 aa24.69■■□□□ 1.54
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