RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029180.13

Rprd1b-201, Transcript of Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rprd1b, Length 4,283 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nsun2Q1HFZ0 757 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ubn1Q4G0F8 1135 aa9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc7a6osQ7TPE5 306 aa9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cpa1Q7TPZ8 419 aa9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nim1kQ8BHI9 436 aa9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nudt13Q8JZU0 352 aa9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Luc7lQ9CYI4 371 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc40a1Q9JHI9 570 aa9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Syt5Q9R0N5 386 aa9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr310B2RVZ1 332 aa9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tex13cD3YU32 604 aa9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 IkbkbO88351 757 aa9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gfpt1P47856 697 aa9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tmed1Q3V009 227 aa9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ccdc84Q4VA36 332 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 DeptorQ570Y9 409 aa9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nod1Q8BHB0 953 aa9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Acat1Q8QZT1 424 aa9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fuca2Q99KR8 461 aa9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sh2b2Q9JID9 621 aa9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Twf2Q9Z0P5 349 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Apc2Q9Z1K7 2274 aa9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cdr2lA2A6T1 465 aa9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tldc2A2ACG1 198 aa9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nova2D3YVV7 556 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gml2G5E8L7 176 aa9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Srrm1Q52KI8 946 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nab2Q61127 525 aa9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cyp2c29Q64458 490 aa9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Prpf38bQ80SY5 542 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Bicd1Q8BR07 835 aa9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Senp7Q8BUH8 1037 aa9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mrgprx1Q8CIP3 322 aa9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Vmn1r213Q8R278 384 aa9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Snap47Q8R570 413 aa9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Usp11Q99K46 921 aa9.6□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ripor3A1L3T7 938 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cdc27A2A6Q5 825 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Klhl41A2AUC9 606 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Map4k1P70218 827 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mark2Q05512 776 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Asic3Q6X1Y6 530 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ddx55Q6ZPL9 600 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cyfip1Q7TMB8 1253 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gprasp2Q8BUY8 826 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Lin7aQ8JZS0 233 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 DolkQ8R2Y3 534 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pcdhb2Q91Y00 799 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 HgsQ99LI8 775 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tsnaxip1Q99P25 704 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Atp6v1e2Q9D593 226 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cst12Q9DAN8 128 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mettl7bQ9DD20 244 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trpc3Q9QZC1 836 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm45194A0A140LJG2 572 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zmynd8A2A484 1235 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 C87977A2A958 498 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Xirp1O70373 1129 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kctd19Q562E2 927 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Avpr1aQ62463 423 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Krt74Q6IFZ9 495 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kiaa1328Q6NZK5 612 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Garem2Q6PAJ3 880 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Asnsd1Q8BFS9 627 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 DaglbQ91WC9 669 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PlgrktQ9D3P8 147 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mfap3lQ9D3X9 409 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dnajb7Q9QYI8 312 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ercc4Q9QZD4 917 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Vnn1Q9Z0K8 512 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm43638A0A0J9YU36 694 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ttc30a2A2AKQ8 664 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Akr1b10G5E895 316 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Krt18P05784 423 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 FlgP11088 336 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cbx2P30658 519 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sox5P35710 763 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Stat3P42227 770 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Eef1dP57776 281 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Klra7Q60654 280 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ddx3xQ62167 662 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Krit1Q6S5J6 736 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tm4sf4Q91XD3 202 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ttc30a1Q99J38 664 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Vwa5aQ99KC8 793 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kif17Q99PW8 1038 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ttc30bQ9CY00 664 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tob2Q9JM55 345 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sycp2lA0A0M3U1B0 842 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ppef2O35385 757 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rpl13P47963 211 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cyp2e1Q05421 493 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zbtb17Q60821 794 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fbxo10Q7TQF2 950 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Klhl29Q80T74 875 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Maip1Q8BHE8 291 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dpp9Q8BVG4 862 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Hexim1Q8R409 356 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Smc6Q924W5 1097 aa9.59□□□□□ -0.87
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Krt20Q9D312 431 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 56.5 ms