RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026296.7

Fgd1-201, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Fgd1, Length 4,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Dlg4Q62108 724 aa15.47■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 PrimpolQ6P1E7 537 aa15.47■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Serpinb13Q8CDC0 389 aa15.47■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Calhm4Q8CE93 315 aa15.47■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Mmgt1Q8K273 131 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Mms19Q9D071 1031 aa15.47■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Neto2Q8BNJ6 525 aa15.47■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Ints9Q8K114 658 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Ccdc137Q8R0K4 290 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Ces1fQ91WU0 561 aa15.47■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Med15Q924H2 789 aa15.47■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Tpd52l2Q9CYZ2 220 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Ascc1Q9D8Z1 356 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Rnf103Q9R1W3 683 aa15.47■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Znfx1Q8R151 1909 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 DgkhD3YXJ0 1156 aa15.47■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Pik3r1P26450 724 aa15.47■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 ProcP33587 460 aa15.47■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 CtshP49935 333 aa15.47■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Tmprss11aQ3UQ41 389 aa15.47■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Ppm1kQ8BXN7 372 aa15.47■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Shtn1Q8K2Q9 631 aa15.47■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Nr3c2Q8VII8 978 aa15.47■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Ppp1r3gQ9CW07 347 aa15.47■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Paip2Q9D6V8 124 aa15.47■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Tmed2Q9R0Q3 201 aa15.47■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Sgk1Q9WVC6 431 aa15.47■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 AfmO89020 608 aa15.46■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Cap1P40124 474 aa15.46■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Nell2Q61220 819 aa15.46■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Tdpoz4Q6YCH2 370 aa15.46■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Caln1Q9JJG7 219 aa15.46■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 JmyQ9QXM1 983 aa15.46■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Tjp2Q9Z0U1 1167 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Osbpl9A2A8Z1 736 aa15.46■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Nr1i3O35627 358 aa15.46■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Il13ra2O88786 383 aa15.46■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Tsta3P23591 321 aa15.46■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Syt2P46097 422 aa15.46■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Slc10a4Q3UEZ8 437 aa15.46■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 PRAG1Q571I4 1179 aa15.46■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Serpinb1cQ5SV42 375 aa15.46■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Ddx3xQ62167 662 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Rassf10Q8BL43 508 aa15.46■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Rhobtb2Q91V93 728 aa15.46■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Polr3fQ921X6 316 aa15.46■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Usp17ldG5E8G2 545 aa15.46■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Usp17lcG5E8I7 545 aa15.46■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 SbdsP70122 250 aa15.46■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Yipf3Q3UDR8 347 aa15.46■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Mageb18Q8BQR7 327 aa15.46■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 AllcQ9JHX6 414 aa15.46■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Dnajb7Q9QYI8 312 aa15.46■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Bnip3lQ9Z2F7 218 aa15.46■□□□□ 0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Aknad1E9Q8N6 675 aa15.46■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Sstr3P30935 428 aa15.46■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Nedd1P33215 660 aa15.46■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Psmd1Q3TXS7 953 aa15.46■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Lgr6Q3UVD5 967 aa15.46■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 WhrnQ80VW5 918 aa15.46■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Slc17a8Q8BFU8 601 aa15.46■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 FtoQ8BGW1 502 aa15.46■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Q8BWG4 1187 aa15.46■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Ccdc15Q8C9M2 810 aa15.46■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 HyiQ8R1F5 277 aa15.46■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Golga1Q9CW79 758 aa15.46■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Serpina9Q9D7D2 418 aa15.46■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Cul1Q9WTX6 776 aa15.46■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa15.45■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Sema3fO88632 785 aa15.45■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Psmc5P62196 406 aa15.45■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Odr4Q4PJX1 447 aa15.45■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Taok1Q5F2E8 1001 aa15.45■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Kcnt1Q6ZPR4 1224 aa15.45■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Tbc1d10cQ8C9V1 444 aa15.45■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Pde6cQ91ZQ1 861 aa15.45■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 NelfcdQ922L6 591 aa15.45■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Txnrd2Q9JLT4 524 aa15.45■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Zfp142G5E869 1843 aa15.45■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 4930523C07RikE9Q2T4 99 aa15.45■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Gm1758F6VZZ1 202 aa15.45■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Becn2P0DM65 447 aa15.45■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 RargP18911 458 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Akr1b8P45377 316 aa15.45■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 AaasP58742 546 aa15.45■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Nlrp4cQ3TKR3 982 aa15.45■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Tm4sf1Q64302 202 aa15.45■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Mysm1Q69Z66 819 aa15.45■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Zcchc2Q69ZB8 1166 aa15.45■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Q6DFW0 481 aa15.45■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Best3Q6H1V1 669 aa15.45■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Ush1gQ80T11 461 aa15.45■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Siglec10Q80ZE3 688 aa15.45■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 IntS13Q8QZV7 732 aa15.45■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Alg1Q921Q3 482 aa15.45■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Actn2Q9JI91 894 aa15.45■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 GgcxQ9QYC7 757 aa15.45■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Mocs3A2BDX3 460 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Rnaseh1O70338 285 aa15.45■□□□□ 0.06
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Znf652Q5DU09 608 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.5 ms