RNA–Protein interactions for RNA: YPL178W

CBC2, Transcript of Small subunit of the heterodimeric cap binding complex with Sto1p, yeast

Gene CBC2, Length 627 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CBC2	YPL178W	YHR219W	P38900	624 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	YEL057C	P39983	233 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	YER010C	P40011	234 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	COG3	P40094	801 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	YTA6	P40328	754 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	MDE1	P47095	244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	MRK1	P50873	501 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	RPN14	P53196	417 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	ASI2	P53895	289 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	YPL039W	Q03080	316 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	SDC1	Q03323	175 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	YML108W	Q03759	105 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	SNX41	Q04053	625 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	FMP45	Q07651	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	COX17	Q12287	69 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	TAF3	Q12297	353 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	WHI5	Q12416	295 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	SEN2	P16658	377 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	PRP28	P23394	588 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	MRPL6	P32904	214 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	MDL1	P33310	695 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	AST1	P35183	429 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	JEN1	P36035	616 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	SRL3	P36167	246 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	PEX18	P38855	283 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	SPO73	P40031	143 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	SHO1	P40073	367 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	SNL1	P40548	159 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	HXT9	P40885	567 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	PRM8	P53174	237 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	HXT11	P54862	567 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	COX20	Q04935	205 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	NTG2	Q08214	380 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	CRT10	Q08226	957 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	DFG16	Q99234	619 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	RIB3	Q99258	208 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	ATR1	P13090	542 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	NUP1	P20676	1076 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	RHB1	P25378	209 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	POL4	P25615	582 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	HSP30	P25619	332 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	ERG9	P29704	444 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	ATS1	P31386	333 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	YEF1	P32622	495 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	TIM12	P32830	109 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	SLM4	P38247	162 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	YEL068C	P39977	110 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	YNL195C	P40168	261 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	YFR054C	P43622	192 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	NIT2	P47016	307 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	YGL101W	P53144	215 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	YGR066C	P53242	292 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	BSC5	P53755	489 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	ABZ2	Q03266	374 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	YPR127W	Q06494	345 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	ARR2	Q06597	130 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	HDA2	Q06629	674 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	IRC19	Q07843	230 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	LOT6	Q07923	191 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	COQ10	Q08058	207 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	BAG7	Q12128	409 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	HER1	Q12276	1246 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	SWM1	Q12379	170 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	SNF6	P18888	332 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	UTR1	P21373	530 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	TRS65	P32893	560 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	SEC66	P33754	206 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	LHS1	P36016	881 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	CHK1	P38147	527 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	SRO77	P38163	1010 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	FET3	P38993	636 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	CHA4	P43634	648 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CBC2	YPL178W	SAM37	P50110	327 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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