RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W YHC1Q05900 231 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W CMS1Q07897 291 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W IRC25Q07951 179 aa3.95□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W IZH2Q12442 317 aa3.95□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W YMR230W-AQ3E7B5 62 aa3.95□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W NAG1Q8TGN9 163 aa3.95□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W SSK22P25390 1331 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W RPS14AP06367 137 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W MIR1P23641 311 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W NAM9P27929 486 aa3.94□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W SKG6P32900 734 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W LSM12P38828 187 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W RPS14BP39516 138 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W SLM1P40485 686 aa3.94□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W YFL040WP43562 540 aa3.94□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W BNS1P50084 137 aa3.94□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W FSH2Q05015 223 aa3.94□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W GAS2Q06135 555 aa3.94□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W YLR173WQ06247 608 aa3.94□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W TY3A-GQ12173 290 aa3.94□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W TY3A-IQ99219 290 aa3.94□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W REP1P03871 373 aa3.93□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W CTA1P15202 515 aa3.93□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W RVS161P25343 265 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W GCG1P32656 232 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W ANR2P36090 516 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W TDA11P38854 504 aa3.93□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W MOB2P43563 287 aa3.93□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W ATG18P43601 500 aa3.93□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W PMT4P46971 762 aa3.93□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W LIA1P47120 325 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W YLR012CQ07927 99 aa3.93□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W RDL2Q08742 149 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W ATP16Q12165 160 aa3.93□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W IZH4Q99393 312 aa3.93□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W SAL1D6W196 494 aa3.92□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data3.92□□□□□ -1.78not detected
YKR047WYKR047W SPS100P13130 326 aa3.92□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W PMT2P31382 759 aa3.92□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W HEM14P40012 539 aa3.92□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W YGR210CP42942 411 aa3.92□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W AIM23P47015 356 aa3.92□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W YJL118WP47022 219 aa3.92□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W YNL134CP53912 376 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W SUR7P54003 302 aa3.92□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W SNX41Q04053 625 aa3.92□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W COX20Q04935 205 aa3.92□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W GMC2Q06201 188 aa3.92□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W ASR1Q06834 288 aa3.92□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W FDH1Q08911 376 aa3.92□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W BTS1Q12051 335 aa3.92□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W MED4Q12343 284 aa3.92□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W ATP6P00854 259 aa3.91□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W ERD1P16151 362 aa3.91□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W GIT1P25346 518 aa3.91□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W CPR3P25719 182 aa3.91□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W PRR1P28708 518 aa3.91□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W LDS1P31379 325 aa3.91□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W KTI12P34253 313 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W COS9P36034 407 aa3.91□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W KAP114P53067 1004 aa3.91□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W BOR1P53838 576 aa3.91□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W YPL077CQ02831 240 aa3.91□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W GPN3Q06543 272 aa3.91□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W RLP24Q07915 199 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W PLP2Q12017 286 aa3.91□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W TAF10Q12030 206 aa3.91□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W MCT1Q12283 360 aa3.91□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W SFM1Q12314 213 aa3.91□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W UTP23Q12339 254 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W RPL31AP0C2H8 113 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
YKR047WYKR047W RPL16BP26785 198 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
YKR047WYKR047W IMP3P32899 183 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
YKR047WYKR047W MRPL10P36520 322 aa3.9□□□□□ -1.79
YKR047WYKR047W PEX22P39718 180 aa3.9□□□□□ -1.79
YKR047WYKR047W OXA1P39952 402 aa3.9□□□□□ -1.79
YKR047WYKR047W YER186CP40101 306 aa3.9□□□□□ -1.79
YKR047WYKR047W SWC4P53201 476 aa3.9□□□□□ -1.79
YKR047WYKR047W VAC7P53950 1165 aa3.9□□□□□ -1.79
YKR047WYKR047W SLT2Q00772 484 aa3.9□□□□□ -1.79
YKR047WYKR047W GRX3Q03835 250 aa3.9□□□□□ -1.79
YKR047WYKR047W CTS2Q06350 511 aa3.9□□□□□ -1.79
YKR047WYKR047W ARV1Q06541 321 aa3.9□□□□□ -1.79
YKR047WYKR047W POM33Q12164 279 aa3.9□□□□□ -1.79
YKR047WYKR047W CBS2P14905 389 aa3.89□□□□□ -1.79
YKR047WYKR047W HPR1P17629 752 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
YKR047WYKR047W NUP2P32499 720 aa3.89□□□□□ -1.79
YKR047WYKR047W PDC2P32896 925 aa3.89□□□□□ -1.79
YKR047WYKR047W YKL063CP35725 167 aa3.89□□□□□ -1.79
YKR047WYKR047W RPC37P36121 282 aa3.89□□□□□ -1.79
YKR047WYKR047W YHR045WP38775 560 aa3.89□□□□□ -1.79
YKR047WYKR047W AIM10P39965 576 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
YKR047WYKR047W YIA6P40556 373 aa3.89□□□□□ -1.79
YKR047WYKR047W BNA6P43619 295 aa3.89□□□□□ -1.79
YKR047WYKR047W PRP38Q00723 242 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
YKR047WYKR047W SKI8Q02793 397 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
YKR047WYKR047W MRX9Q07349 420 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
YKR047WYKR047W RUD3Q12234 484 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
YKR047WYKR047W ILV1P00927 576 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
YKR047WYKR047W POL30P15873 258 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 34.5 ms