RNA–Protein interactions for RNA: YJL114W

YJL114W, Transcript of Retrotransposon TYA Gag gene co-transcribed with TYB Pol, yeast

Gene YJL114W, Length 681 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL114W	YJL114W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	REP1	P03871	373 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	DAL80	P26343	269 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	ECT1	P33412	323 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	YKL162C	P36052	402 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	MRPL40	P36534	297 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	INA22	P40576	216 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	STB1	P42845	420 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	BIO3	P50277	480 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	YPS5	P53057	165 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	VOA1	P53262	265 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	MKC7	P53379	596 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	SCS7	Q03529	384 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	LDB17	Q12342	491 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	PSK1	P31374	1356 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	CTA1	P15202	515 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	MEI5	P32489	222 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	PDC2	P32896	925 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	FHL1	P39521	936 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	LOH1	P47055	219 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	GPI8	P49018	411 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	YGL262W	P53054	175 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	KTR6	P54070	446 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	RMI1	Q02685	241 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	VAC14	Q06708	880 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	SRO7	Q12038	1033 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	YPR1	Q12458	312 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YJL114W	YJL114W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	YKL071W	P36086	256 aa		2.58	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	DTR1	P38125	572 aa		2.58	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	CHL4	P38907	458 aa		2.58	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	IRC4	Q03036	179 aa		2.58	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	MRX11	Q03079	207 aa		2.58	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	ECM18	Q04623	453 aa		2.58	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	FAR10	Q06001	478 aa		2.58	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	RRG8	Q06109	277 aa		2.58	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		2.58	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	SPS100	P13130	326 aa		2.57	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	UGA1	P17649	471 aa		2.57	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	SMP1	P38128	452 aa		2.57	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	MRP21	P38175	177 aa		2.57	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	YFL040W	P43562	540 aa		2.57	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	PMT4	P46971	762 aa		2.57	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	VEL1	P53058	206 aa		2.57	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	YGR018C	P53211	109 aa		2.57	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	OKP1	P53298	406 aa		2.57	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	UBX2	Q04228	584 aa		2.57	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	YLR012C	Q07927	99 aa		2.57	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	PRM4	Q12498	284 aa		2.57	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	GAL7	P08431	366 aa		2.56	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	ZRT1	P32804	376 aa		2.56	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	RPC25	P35718	212 aa		2.56	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	YHR035W	P38769	630 aa		2.56	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	TPC1	P53257	314 aa		2.56	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	NRM1	P53718	249 aa		2.56	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	YPL080C	Q02826	108 aa		2.56	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	SPO19	Q03029	223 aa		2.56	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	APC4	Q04601	652 aa		2.56	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	YLR413W	Q06689	675 aa		2.56	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	MCH1	Q07376	486 aa		2.56	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	MHP1	P43638	1398 aa		2.56	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	EPT1	P22140	391 aa		2.55	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	GGC1	P38988	300 aa		2.55	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	DSE1	P40077	573 aa		2.55	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	COX16	P47081	118 aa		2.55	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	BIO4	P53630	237 aa		2.55	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	VHS1	Q03785	461 aa		2.55	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	SNX41	Q04053	625 aa		2.55	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	SIA1	Q12212	622 aa		2.55	□□□□□ -2
YJL114W	YJL114W	STE2	D6VTK4	431 aa		2.54	□□□□□ -2

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