RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 FOXO6A8MYZ6 492 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD63C9JTQ0 380 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 MED24O75448 989 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 TTC27Q6P3X3 843 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 OTUD6AQ7L8S5 288 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 CARD9Q9H257 536 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 MLXIPLQ9NP71 852 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 STK38LQ9Y2H1 464 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 LDHBP07195 334 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 VCAM1P19320 739 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 RXRBP28702 533 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 PDE6BP35913 854 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 PEX19P40855 299 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 MARCKSL1P49006 195 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 SLC12A3P55017 1021 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 ADCY2Q08462 1091 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 SFR1Q86XK3 245 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 BATF3Q9NR55 127 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 FAM187AA6NFU0 413 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 TCP11X1B4DZS4 312 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 HGSO14964 777 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 RIPK2O43353 540 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 C6orf118Q5T5N4 469 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 EXOC3L1Q86VI1 746 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 NT5C3AQ9H0P0 336 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 KIF9Q9HAQ2 790 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa22.14■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 PLCG2P16885 1265 aa22.14■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 KCNA1Q09470 495 aa22.14■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 SMIM5Q71RC9 77 aa22.14■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 KLHL29Q96CT2 875 aa22.14■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 ASTN1O14525 1302 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 ANXA13P27216 316 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 NT5C2P49902 561 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 PDE6CP51160 858 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 PSMC6P62333 389 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 BNIP1Q12981 228 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 PRELID2Q8N945 189 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 KRT35Q92764 455 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 THAP2Q9H0W7 228 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 CLIC2O15247 247 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 SMARCA1P28370 1054 aa22.13■■□□□ 1.13
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PMS1-222ENST00000639501 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 IRS2Q9Y4H2 1338 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 MEIS1O00470 390 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 RASGRF2O14827 1237 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 TMEM253P0C7T8 217 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 COPS2P61201 443 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 RSPH10BP0C881 870 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 FERP16591 822 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 ABL2P42684 1182 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 GIT2Q14161 759 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 LONRF1Q17RB8 773 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 MAEAQ7L5Y9 396 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 FITM2Q8N6M3 262 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 RMDN2Q96LZ7 410 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 REEP2Q9BRK0 252 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 SYT11Q9BT88 431 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 ADAM22Q9P0K1 906 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 PHF2O75151 1096 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 NR3C1P04150 777 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 DRG2P55039 364 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 INHBEP58166 350 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 C11orf91Q3C1V1 193 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.12■■□□□ 1.13
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