RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611636.4

WHAMMP3-201, Transcript of WAS protein homolog associated with actin, golgi membranes and microtubules pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene WHAMMP3, Length 1,609 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMP3-201ENST00000611636 RNF208Q9H0X6 261 aa27.41■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa27.41■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 IKBKBO14920 756 aa27.41■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 SLC16A4O15374 487 aa27.41■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 GLRA2P23416 452 aa27.41■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 TMOD1P28289 359 aa27.41■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 NCKAP1LP55160 1127 aa27.41■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 ALCAMQ13740 583 aa27.41■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 HDAC6Q9UBN7 1215 aa27.41■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 UBE4BO95155 1302 aa27.4■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 MOXD2PA6NHM9 499 aa27.4■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa27.4■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 CABYRO75952 493 aa27.4■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 GNAT1P11488 350 aa27.4■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 NAMPTP43490 491 aa27.4■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 CLCN3P51790 818 aa27.4■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 ACLYP53396 1101 aa27.4■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 NBPF20Q3BBV1 942 aa27.4■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 NFRKBQ6P4R8 1299 aa27.4■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 HAUS6Q7Z4H7 955 aa27.4■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 ZNF507Q8TCN5 953 aa27.4■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 P2RX5Q93086 422 aa27.4■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa27.4■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 C17orf102A2RUQ5 167 aa27.39■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 CCNE1P24864 410 aa27.39■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 BMT2Q1RMZ1 405 aa27.39■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 NELFCDQ8IXH7 590 aa27.39■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 LINC01465Q8N7H1 131 aa27.39■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 DEFB118Q96PH6 123 aa27.39■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 MED15Q96RN5 788 aa27.39■■□□□ 1.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 BICDL2A1A5D9 508 aa27.38■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa27.38■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 CENPPQ6IPU0 288 aa27.38■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 STRA6Q9BX79 667 aa27.38■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 LRRIQ4A6NIV6 560 aa27.38■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 H0YCG3 227 aa27.38■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 PPP1R37O75864 691 aa27.38■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 HOXC8P31273 242 aa27.38■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 ADAM17P78536 824 aa27.38■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 CCDC173Q0VFZ6 552 aa27.38■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 RHPN2Q8IUC4 686 aa27.38■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa27.38■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 VTI1AQ96AJ9 217 aa27.38■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 KIFC3Q9BVG8 833 aa27.38■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 SEMA6BQ9H3T3 888 aa27.38■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 SIP14410 1827 aa27.37■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 TRIM49BA6NDI0 452 aa27.37■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 KBTBD13C9JR72 458 aa27.37■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 ASAP2O43150 1006 aa27.37■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 GTF2BQ00403 316 aa27.37■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 CAPSQ13938 189 aa27.37■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 NCAPHQ15003 741 aa27.37■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 SPATA1Q5VX52 437 aa27.37■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 DEPTORQ8TB45 409 aa27.37■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 MAP7D2Q96T17 732 aa27.37■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 AKT3Q9Y243 479 aa27.37■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 SCP2P22307 547 aa27.36■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 ABCD1P33897 745 aa27.36■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 PMS1P54277 932 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 HIC1Q14526 733 aa27.36■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 FAM47CQ5HY64 1035 aa27.36■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 ANKRD40Q6AI12 368 aa27.36■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 KSR1Q8IVT5 923 aa27.36■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 GLT1D1Q96MS3 346 aa27.36■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 TSG101Q99816 390 aa27.36■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 KCTD10Q9H3F6 313 aa27.36■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa27.36■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa27.36■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa27.36■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa27.35■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 DNAH12Q6ZR08 3092 aa27.35■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 BRCA2P51587 3418 aa27.35■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 DENND3A2RUS2 1198 aa27.35■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 CCDC85CA6NKD9 419 aa27.35■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 HOXD13P35453 343 aa27.35■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 TPM4P67936 248 aa27.35■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 LRRC63Q05C16 580 aa27.35■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 KCNA1Q09470 495 aa27.35■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 TFDP1Q14186 410 aa27.35■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 TTI2Q6NXR4 508 aa27.35■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 HVCN1Q96D96 273 aa27.35■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa27.34■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 TREHO43280 583 aa27.34■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 GJB1P08034 283 aa27.34■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa27.34■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 CYP2C9P11712 490 aa27.34■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 UVSSAQ2YD98 709 aa27.34■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 SESTD1Q86VW0 696 aa27.34■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa27.34■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 ACCSQ96QU6 501 aa27.34■■□□□ 1.97
WHAMMP3-201ENST00000611636 TMEM106CQ9BVX2 250 aa27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms