RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	COPS5	Q92905	334 aa		10.7	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		10.7	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		10.7	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	ATP8B1	O43520	1251 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	MFAP3L	O75121	409 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	PSMD10	O75832	226 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	KCNH2	Q12809	1159 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	TTI2	Q6NXR4	508 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC5A5	Q92911	643 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	NACC1	Q96RE7	527 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	TRPC6	Q9Y210	931 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	TBC1D8	O95759	1140 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	CCND2	P30279	289 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	PGM5	Q15124	567 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	ERO1B	Q86YB8	467 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	EXOC4	Q96A65	974 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	PXMP2	Q9NR77	195 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	TLDC2	A0PJX2	215 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	SASH3	O75995	380 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	SLITRK3	O94933	977 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	PSMD2	Q13200	908 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	ODF2	Q5BJF6	829 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	KCTD16	Q68DU8	428 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	THAP9	Q9H5L6	903 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	GLTPD2	A6NH11	291 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	CEP104	O60308	925 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	GRIN3B	O60391	1043 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	NDUFA10	O95299	355 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	EYA4	O95677	639 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	EPHA7	Q15375	998 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	PADI6	Q6TGC4	694 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	GOLGA1	Q92805	767 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	GCNT4	Q9P109	453 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	RCCD1	A6NED2	376 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	ATP2C2	O75185	946 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	FGFR4	P22455	802 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	PPP2R5A	Q15172	486 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	KAT5	Q92993	513 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	OPTN	Q96CV9	577 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232		F5H423	210 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	HIP1R	O75146	1068 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	KRT13	P13646	458 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC12A3	P55017	1021 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	BTBD6	Q96KE9	485 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	RIT2	Q99578	217 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	POTEB2	H3BUK9	544 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	KCNK3	O14649	394 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	ERLIN1	O75477	346 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	SEMA3F	Q13275	785 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	LY6K	Q17RY6	165 aa		10.67	□□□□□ -0.7

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