RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596351.5

LTBP4-215, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 2

Gene LTBP4, Length 512 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-215	ENST00000596351	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	FAM122A	Q96E09	287 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	PIEZO1	Q92508	2521 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351		A0A0U1RQF3	1178 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	HOXA2	O43364	376 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	CDKL5	O76039	1030 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	EYA4	O95677	639 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	AK2	P54819	239 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	PSMC5	P62195	406 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	COASY	Q13057	564 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	POTED	Q86YR6	584 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	NECAB1	Q8N987	351 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	HAS1	Q92839	578 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	LPP	Q93052	612 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	NLRP4	Q96MN2	994 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	ZNF558	Q96NG5	402 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	TCF25	Q9BQ70	676 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	HIDE1	A8MVS5	230 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	PRR33	A8MZF0	331 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	DNM2	P50570	870 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	FOSB	P53539	338 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	PLCB3	Q01970	1234 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	NR5A1	Q13285	461 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	PPP2R5C	Q13362	524 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	RNF135	Q8IUD6	432 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	APOL5	Q9BWW9	433 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	DACT1	Q9NYF0	836 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	LZTS1	Q9Y250	596 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	XBP1	P17861	261 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	PPM1A	P35813	382 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	PHKA2	P46019	1235 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	CYP4A11	Q02928	519 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	ZNF410	Q86VK4	478 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	TMEM143	Q96AN5	459 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	FAM20A	Q96MK3	541 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	LXN	Q9BS40	222 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	SPG21	Q9NZD8	308 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	RGL1	Q9NZL6	768 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	MYO10	Q9HD67	2058 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	ZBTB39	O15060	712 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	EOMES	O95936	686 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	TEC	P42680	631 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	BCAR1	P56945	870 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	ANAPC15	P60006	121 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	KCNC3	Q14003	757 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	ME3	Q16798	604 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	TMC7	Q7Z402	723 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	TNFRSF25	Q93038	417 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	DYDC2	Q96IM9	177 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	CEP170P1	Q96L14	293 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	CDH22	Q9UJ99	828 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-215	ENST00000596351	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-215	ENST00000596351	WNT7A	O00755	349 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-215	ENST00000596351	MARCH6	O60337	910 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-215	ENST00000596351	B4GALT3	O60512	393 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-215	ENST00000596351	JAK2	O60674	1132 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-215	ENST00000596351	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25

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