RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 BCAR1P56945 870 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 ITIH3Q06033 890 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 DRP2Q13474 957 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 LRCH2Q5VUJ6 765 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 CES5AQ6NT32 575 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 ZBTB33Q86T24 672 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 RDM1Q8NG50 284 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 RSPH1Q8WYR4 309 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 NECTIN4Q96NY8 510 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 CEP89Q96ST8 783 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 TEKT3Q9BXF9 490 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC26A6Q9BXS9 759 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 ADAM7Q9H2U9 754 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 POMKQ9H5K3 350 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 SH3GLB2Q9NR46 395 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 SNX14Q9Y5W7 946 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 CFAP54Q96N23 3096 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 PSMD10O75832 226 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 RPS6KB1P23443 525 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 HSPA4P34932 840 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 CDC42EP1Q00587 391 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 MTERF2Q49AM1 385 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 B3GNT9Q6UX72 402 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 MIER3Q7Z3K6 550 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 TBCKQ8TEA7 893 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 GJA10Q969M2 543 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM169Q96HH4 297 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 RIPOR3Q96MK2 946 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 TRAIPQ9BWF2 469 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 ZBP1Q9H171 429 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 CHST12Q9NRB3 414 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A087WZ62 844 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 CARNS1A5YM72 827 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM150BA6NC51 233 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 C2CD4DB7Z1M9 353 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 STBD1O95210 358 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 CXCL14O95715 111 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 CA8P35219 290 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 PHKA2P46019 1235 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 EVCP57679 992 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 NLRP5P59047 1200 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 MTMR3Q13615 1198 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 Q4G0T1 1027 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 XKR3Q5GH77 459 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF410Q86VK4 478 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 UBALD2Q8IYN6 164 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 VPS52Q8N1B4 723 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 KREMEN2Q8NCW0 462 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 C22orf23Q9BZE7 217 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 SORCS3Q9UPU3 1222 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 IRAK3Q9Y616 596 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 DENND4AQ7Z401 1863 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 CACNA1HO95180 2353 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 ST18O60284 1047 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 TDP2O95551 362 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 BRD1O95696 1058 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 CTSAP10619 480 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 SKIP12755 728 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 CYP3A7P24462 503 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 MTHFRP42898 656 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 DNM2P50570 870 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 NUBP1P53384 320 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 CCT2P78371 535 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 GIT2Q14161 759 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 KIAA1841Q6NSI8 718 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 ETNPPLQ8TBG4 499 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 AUTS2Q8WXX7 1259 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 LPPQ93052 612 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 IGSF21Q96ID5 467 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 SH2D3AQ9BRG2 576 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM105AQ9NUU6 356 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 TBC1D13Q9NVG8 400 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM86C1Q9NVL1 165 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 DZANK1Q9NVP4 752 aa11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms