RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592535.5

APOC1-208, Transcript of apolipoprotein C1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene APOC1, Length 430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1-208ENST00000592535 VCANP13611 3396 aa15.5■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 ST18O60284 1047 aa15.5■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 LYPLA2O95372 231 aa15.5■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP15.5■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 DNAJB1P25685 340 aa15.5■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 ZNF174Q15697 407 aa15.5■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 NAALADL2Q58DX5 795 aa15.5■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 EXOC8Q8IYI6 725 aa15.5■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 RNF169Q8NCN4 708 aa15.5■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 SPPL3Q8TCT6 385 aa15.5■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 NEK9Q8TD19 979 aa15.5■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 TMEM117Q9H0C3 514 aa15.5■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 IFT122Q9HBG6 1241 aa15.5■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 TTC28Q96AY4 2481 aa15.5■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 A0A087WWV3 80 aa15.49■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 A0A0U1RQF3 1178 aa15.49■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 TNFRSF10AO00220 468 aa15.49■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 HOXA2O43364 376 aa15.49■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 KCNA5P22460 613 aa15.49■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 CATSPER4Q7RTX7 472 aa15.49■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 NOSTRINQ8IVI9 506 aa15.49■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 POF1BQ8WVV4 589 aa15.49■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 CASD1Q96PB1 797 aa15.49■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 MTRQ99707 1265 aa15.49■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 CWH43Q9H720 699 aa15.49■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa15.49■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 CHST12Q9NRB3 414 aa15.49■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 DACT1Q9NYF0 836 aa15.49■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 GAS2O43903 313 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 OR52Z1P0C646 297 aa15.48■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa15.48■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 IRS1P35568 1242 aa15.48■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 TECP42680 631 aa15.48■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa15.48■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 NBR1Q14596 966 aa15.48■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 CLLU1OSQ5K130 101 aa15.48■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 TTC38Q5R3I4 469 aa15.48■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 LRRC55Q6ZSA7 311 aa15.48■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 FERMT3Q86UX7 667 aa15.48■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 ABI1Q8IZP0 508 aa15.48■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa15.48■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 TCP11Q8WWU5 503 aa15.48■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 TMX3Q96JJ7 454 aa15.48■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 AAASQ9NRG9 546 aa15.48■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 ANKEF1Q9NU02 776 aa15.48■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa15.48■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 EOMESO95936 686 aa15.47■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa15.47■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 PHKA2P46019 1235 aa15.47■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 RARRES1P49788 294 aa15.47■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 HYAL1Q12794 435 aa15.47■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 COL19A1Q14993 1142 aa15.47■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 LEXMQ3ZCV2 418 aa15.47■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 EP400NLQ6ZTU2 488 aa15.47■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa15.47■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 LRRC43Q8N309 656 aa15.47■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 RNF149Q8NC42 400 aa15.47■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 HELQQ8TDG4 1101 aa15.47■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 PIGOQ8TEQ8 1089 aa15.47■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 TBC1D32Q96NH3 1257 aa15.47■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 TRAIPQ9BWF2 469 aa15.47■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 MINDY3Q9H8M7 445 aa15.47■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa15.47■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 CLDND1Q9NY35 253 aa15.47■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa15.47■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 H3BQ06 376 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 ASAP2O43150 1006 aa15.46■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 MED24O75448 989 aa15.46■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 FGF18O76093 207 aa15.46■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 LAG3P18627 525 aa15.46■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP15.46■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP15.46■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 TRAPPC10P48553 1259 aa15.46■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 LONRF3Q496Y0 759 aa15.46■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa15.46■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 CATSPER3Q86XQ3 398 aa15.46■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 THNSL1Q8IYQ7 743 aa15.46■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 LPPQ93052 612 aa15.46■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 IGFLR1Q9H665 355 aa15.46■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 TUFT1Q9NNX1 390 aa15.46■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 FAM105AQ9NUU6 356 aa15.46■□□□□ 0.07
APOC1-208ENST00000592535 NCOR1O75376 2440 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC1-208ENST00000592535 USO1O60763 962 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
APOC1-208ENST00000592535 DGAT1O75907 488 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms