RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 CCNE2O96020 404 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 PSAPP07602 524 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 CAMK1Q14012 370 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 NCAPH2Q6IBW4 605 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 GDPD2Q9HCC8 539 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 DISC1Q9NRI5 854 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A1W2PQ27 194 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A1W2PQ64 194 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A1W2PQD8 194 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 PRR23AA6NEV1 266 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 CHMP2AO43633 222 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 MUTP22033 750 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 HOXC8P31273 242 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 TXLNAP40222 546 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 KRT79Q5XKE5 535 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 KCTD17Q8N5Z5 321 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 GPR20Q99678 358 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 CSRNP2Q9H175 543 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 PLAGL2Q9UPG8 496 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 POTEMA6NI47 508 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 ABHD15Q6UXT9 468 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 C16orf70Q9BSU1 422 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 SAMM50Q9Y512 469 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 TREHO43280 583 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 CSPG5O95196 566 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 CTSHP09668 335 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 UBA7P41226 1012 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 NBL1P41271 181 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 ID4P47928 161 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 HSDL1Q3SXM5 330 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 P2RX5Q93086 422 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 CLIC6Q96NY7 704 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 CCSER1Q9C0I3 900 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 BCAS3Q9H6U6 928 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 TUFT1Q9NNX1 390 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 EML1O00423 815 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 P4HBP07237 508 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 CMA1P23946 247 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 SP4Q02446 784 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 GRIN1Q05586 938 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM160B1Q5W0V3 765 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM13BQ9NYF5 915 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 DOCK5Q9H7D0 1870 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 RPA1P27694 616 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC26A2P50443 739 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 PTPN21Q16825 1174 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 NAALADL2Q58DX5 795 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 RESP18Q5W5W9 173 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 SNX29Q8TEQ0 813 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 HSD17B14Q9BPX1 270 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 AZI2Q9H6S1 392 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 H3BRB1 525 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 SORBS3O60504 671 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 UBE2HP62256 183 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 HYIQ5T013 277 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 SHC4Q6S5L8 630 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 CABP7Q86V35 215 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 CALML4Q96GE6 196 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 RIPOR3Q96MK2 946 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 NT5C3AQ9H0P0 336 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 RNPEPQ9H4A4 650 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC39Q9UFE4 941 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 PTMSP20962 102 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 DNAJB1P25685 340 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 QARSP47897 775 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 PSMC5P62195 406 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM26DQ5JW98 314 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF302Q9NR11 478 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 DDX11L8A8MPP1 907 aa26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms