RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMD10O75832 226 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 STBD1O95210 358 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 BCAR1P56945 870 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 CCT2P78371 535 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 MTERF2Q49AM1 385 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 TBCKQ8TEA7 893 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 POMKQ9H5K3 350 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 DACT1Q9NYF0 836 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 TPRNQ4KMQ1 711 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB33Q86T24 672 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 SH2D3AQ9BRG2 576 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 TDP2O95551 362 aa28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 CA8P35219 290 aa28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 NLRP5P59047 1200 aa28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 MIER3Q7Z3K6 550 aa28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAM7Q9H2U9 754 aa28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 SH3GLB2Q9NR46 395 aa28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A087WZ62 844 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 PHKA2P46019 1235 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 Q4G0T1 1027 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 B3GNT9Q6UX72 402 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 RDM1Q8NG50 284 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 LPPQ93052 612 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 CHST12Q9NRB3 414 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 NR2E1Q9Y466 385 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR81Q562E7 1941 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 C2CD4DB7Z1M9 353 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 AVPR2P30518 371 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 EVCP57679 992 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 ITIH3Q06033 890 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 LONRF3Q496Y0 759 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 XKR3Q5GH77 459 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 CES5AQ6NT32 575 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 KREMEN2Q8NCW0 462 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 AUTS2Q8WXX7 1259 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM169Q96HH4 297 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBP1Q9H171 429 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM86C1Q9NVL1 165 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 CXCL14O95715 111 aa28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 WEE2P0C1S8 567 aa28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 VPS52Q8N1B4 723 aa28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 NECTIN4Q96NY8 510 aa28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAIPQ9BWF2 469 aa28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHA4Q9UN74 947 aa28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 MEIS3P2A8K0S8 358 aa28.83■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP28.83■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 RIPOR3Q96MK2 946 aa28.83■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 M0R2N6 131 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP3A7P24462 503 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 CDC42EP1Q00587 391 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 KANK3Q6NY19 840 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 RHPN2Q8IUC4 686 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 KSR1Q8IVT5 923 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 ETNPPLQ8TBG4 499 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 SMOC2Q9H3U7 446 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D13Q9NVG8 400 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 BRD1O95696 1058 aa28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 DNM2P50570 870 aa28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 MTMR3Q13615 1198 aa28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF410Q86VK4 478 aa28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 IGSF21Q96ID5 467 aa28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 MBOAT7Q96N66 472 aa28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 C22orf23Q9BZE7 217 aa28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM105AQ9NUU6 356 aa28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 SORCS3Q9UPU3 1222 aa28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX11L8A8MPP1 907 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 MAFO75444 373 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 CTSAP10619 480 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 EPCAMP16422 314 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMA5P28066 241 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 MTHFRP42898 656 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 NPY5RQ15761 445 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 PLA2G4FQ68DD2 849 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 ANO5Q75V66 913 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
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