RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589669.1

CCDC130-211, Transcript of coiled-coil domain containing 130, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC130, Length 701 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130-211ENST00000589669 GHRP10912 638 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 SKIP12755 728 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 FDPSP14324 419 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 IGFBP4P22692 258 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 DISC1Q9NRI5 854 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 CDY2AQ9Y6F7 541 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 COL1A2P08123 1366 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 J3QL48 77 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 ATP9BO43861 1147 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 GAS7O60861 476 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 SFNP31947 248 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 ERVK-21P61565 698 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 B3GNT9Q6UX72 402 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 MYOCDQ8IZQ8 938 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 NECAB1Q8N987 351 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 RDM1Q8NG50 284 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 ARNTL2Q8WYA1 636 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 GTF3C6Q969F1 213 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 CERS4Q9HA82 394 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 NRBP2Q9NSY0 501 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 GABBR1Q9UBS5 961 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 SAMM50Q9Y512 469 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 LINC01553A4QN01 128 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 EPOPA6NHQ4 379 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 M0QZ92 97 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 RFXAPO00287 272 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 DLL1O00548 723 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 TDP2O95551 362 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 JAK3P52333 1124 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 NR5A1Q13285 461 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 LRCH2Q5VUJ6 765 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 PPP4R3AQ6IN85 833 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 FAM117BQ6P1L5 589 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 CKAP2LQ8IYA6 745 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 PLPP7Q8NBV4 271 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 ETNPPLQ8TBG4 499 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 FAM167AQ96KS9 214 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 TEKT3Q9BXF9 490 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 LMCD1Q9NZU5 365 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 CEP131Q9UPN4 1083 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 TRPV2Q9Y5S1 764 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 MTCH2Q9Y6C9 303 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 KAT6AQ92794 2004 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 MAGEB2O15479 319 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 ZNF862O60290 1169 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 INF2Q27J81 1249 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 FAM20AQ96MK3 541 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 FTHL17Q9BXU8 183 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 UNC45AQ9H3U1 944 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 GJB4Q9NTQ9 266 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 PADI3Q9ULW8 664 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 WASF2Q9Y6W5 498 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 LPXNO60711 386 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 UPP2O95045 317 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 LARGE1O95461 756 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 C22orf31O95567 290 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 CD52P31358 61 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 TMEM62Q0P6H9 643 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 GRB10Q13322 594 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 LETM2Q2VYF4 491 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 C8orf34Q49A92 452 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 SPRED2Q7Z698 418 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 NEK8Q86SG6 692 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 CRIPAKQ8N1N5 446 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 PPM1EQ8WY54 764 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 GJA10Q969M2 543 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 SUGCTQ9HAC7 445 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 CUL9Q8IWT3 2517 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 XIRP2A4UGR9 3374 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 ERVH48-1M5A8F1 160 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 TBX3O15119 743 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 DTNBO60941 627 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 NNTQ13423 1086 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 MIER3Q7Z3K6 550 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 CCDC116Q8IYX3 515 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms