RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580814.1

TSG101-211, Transcript of tumor susceptibility 101, humanhuman

TSL 2

Gene TSG101, Length 441 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101-211ENST00000580814 SLC52A1Q9NWF4 448 aa7.41□□□□□ -1.22
TSG101-211ENST00000580814 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
TSG101-211ENST00000580814 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa7.41□□□□□ -1.22
TSG101-211ENST00000580814 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa7.41□□□□□ -1.22
TSG101-211ENST00000580814 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa7.41□□□□□ -1.22
TSG101-211ENST00000580814 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa7.41□□□□□ -1.22
TSG101-211ENST00000580814 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa7.41□□□□□ -1.22
TSG101-211ENST00000580814 EID1Q9Y6B2 187 aa7.41□□□□□ -1.22
TSG101-211ENST00000580814 C9orf118A6NHY6 69 aa7.4□□□□□ -1.22
TSG101-211ENST00000580814 ADCY8P40145 1251 aa7.4□□□□□ -1.22
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TSG101-211ENST00000580814 HOOK2Q96ED9 719 aa7.4□□□□□ -1.22
TSG101-211ENST00000580814 TMEM168Q9H0V1 697 aa7.4□□□□□ -1.22
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TSG101-211ENST00000580814 TMEM240Q5SV17 173 aa7.39□□□□□ -1.23
TSG101-211ENST00000580814 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TSG101-211ENST00000580814 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa7.39□□□□□ -1.23
TSG101-211ENST00000580814 DYDC2Q96IM9 177 aa7.39□□□□□ -1.23
TSG101-211ENST00000580814 SPATA25Q9BR10 227 aa7.39□□□□□ -1.23
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TSG101-211ENST00000580814 USP18Q9UMW8 372 aa7.39□□□□□ -1.23
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TSG101-211ENST00000580814 NUAK1O60285 661 aa7.38□□□□□ -1.23
TSG101-211ENST00000580814 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
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TSG101-211ENST00000580814 CIAPIN1Q6FI81 312 aa7.38□□□□□ -1.23
TSG101-211ENST00000580814 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
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TSG101-211ENST00000580814 KLHL36Q8N4N3 616 aa7.38□□□□□ -1.23
TSG101-211ENST00000580814 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TSG101-211ENST00000580814 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TSG101-211ENST00000580814 SOX7Q9BT81 388 aa7.38□□□□□ -1.23
TSG101-211ENST00000580814 IFT122Q9HBG6 1241 aa7.38□□□□□ -1.23
TSG101-211ENST00000580814 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
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TSG101-211ENST00000580814 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa7.38□□□□□ -1.23
TSG101-211ENST00000580814 ADAM29Q9UKF5 820 aa7.38□□□□□ -1.23
TSG101-211ENST00000580814 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa7.38□□□□□ -1.23
TSG101-211ENST00000580814 A0A1B0GTL3 188 aa7.37□□□□□ -1.23
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TSG101-211ENST00000580814 KCNQ1P51787 676 aa7.37□□□□□ -1.23
TSG101-211ENST00000580814 PPARAQ07869 468 aa7.37□□□□□ -1.23
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TSG101-211ENST00000580814 ODF1Q14990 250 aa7.37□□□□□ -1.23
TSG101-211ENST00000580814 CLUL1Q15846 466 aa7.37□□□□□ -1.23
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TSG101-211ENST00000580814 ZNF827Q17R98 1081 aa7.37□□□□□ -1.23
TSG101-211ENST00000580814 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa7.37□□□□□ -1.23
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TSG101-211ENST00000580814 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TSG101-211ENST00000580814 CPA6Q8N4T0 437 aa7.37□□□□□ -1.23
TSG101-211ENST00000580814 TSPEARQ8WU66 669 aa7.37□□□□□ -1.23
TSG101-211ENST00000580814 JADE3Q92613 823 aa7.37□□□□□ -1.23
TSG101-211ENST00000580814 FATE1Q969F0 183 aa7.37□□□□□ -1.23
TSG101-211ENST00000580814 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TSG101-211ENST00000580814 CARD11Q9BXL7 1154 aa7.37□□□□□ -1.23
TSG101-211ENST00000580814 CDH19Q9H159 772 aa7.37□□□□□ -1.23
TSG101-211ENST00000580814 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TSG101-211ENST00000580814 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
TSG101-211ENST00000580814 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TSG101-211ENST00000580814 FSBPO95073 299 aa7.36□□□□□ -1.23
TSG101-211ENST00000580814 HMGCRP04035 888 aa7.36□□□□□ -1.23
TSG101-211ENST00000580814 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
TSG101-211ENST00000580814 NRG3P56975 720 aa7.36□□□□□ -1.23
TSG101-211ENST00000580814 KLHDC10Q6PID8 442 aa7.36□□□□□ -1.23
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