RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 TTC25Q96NG3 672 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.247e-7■■■□□ 14.6
PTPRM-211ENST00000580170 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 ATP5HO75947 161 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 GPR162Q16538 588 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 TTC13Q8NBP0 860 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 KRT10P13645 584 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 KLHL38Q2WGJ6 581 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM270Q6UE05 265 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 DSTYKQ6XUX3 929 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 MLXIPLQ9NP71 852 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 GRM4Q14833 912 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 FAM182BQ5T319 152 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 ASNSD1Q9NWL6 643 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 TTC26A0AVF1 554 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 KIF28PB7ZC32 967 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM35BQ8NCS4 154 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 SLC16A4O15374 487 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 PAMP19021 973 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 NLRP14Q86W24 1093 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 POLD4Q9HCU8 107 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 STOML1Q9UBI4 398 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 LCMT1Q9UIC8 334 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 NCAPD2Q15021 1401 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 ABCB11O95342 1321 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 KRT38O76015 456 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 PPP1R18Q6NYC8 613 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 USP17L10C9JJH3 530 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 CALB1P05937 261 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 PRDX5P30044 214 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 RCAN1P53805 252 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 FAM213AQ9BRX8 229 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 OCA2Q04671 838 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 C11orf70Q9BRQ4 267 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGEF37A1IGU5 675 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 CACNB3P54284 484 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 CDR2Q01850 454 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 SHC4Q6S5L8 630 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 GIPC2Q8TF65 315 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 SUFUQ9UMX1 484 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 PP2D1A8MPX8 630 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 FOXN1O15353 648 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 FSCBQ5H9T9 825 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 HEY1Q9Y5J3 304 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 CLDN3O15551 220 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 NPR1P16066 1061 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF699Q32M78 642 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 FAM8A1Q9UBU6 413 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 VAMP7P51809 220 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 VPS39Q96JC1 886 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.23
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PTPRM-211ENST00000580170 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 UBE4BO95155 1302 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 CHRNA3P32297 505 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 CRKP46108 304 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGAP18Q8N392 663 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 BARHL2Q9NY43 387 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 PALLDQ8WX93 1383 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 POTEFA5A3E0 1075 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 POTEIP0CG38 1075 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 MCF2P10911 925 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 NOP14P78316 857 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 POTEGQ6S5H5 508 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 ECT2Q9H8V3 914 aa22.74■■□□□ 1.23
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