RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579969.1

SNORD53-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 53, humanhuman

BASIC

Gene SNORD53, Length 78 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD53-201ENST00000579969 ZBED9Q6R2W3 1325 aa2.81□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 KIAA1671Q9BY89 1806 aa2.81□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 MIA3Q5JRA6 1907 aa2.81□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa2.81□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 GON4LQ3T8J9 2241 aa2.81□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa2.81□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 TENM4Q6N022 2769 aa2.81□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 KNTC1P50748 2209 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 MYH4Q9Y623 1939 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 WDR19Q8NEZ3 1342 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 RRN3P2A6NIE6 340 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 SHISA7A6NL88 538 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 GSG1L2A8MUP6 293 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 H0Y626 953 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 MAN2B1O00754 1011 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 GPR182O15218 404 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 INPPL1O15357 1258 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 HOXA2O43364 376 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 GAS2O43903 313 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 KRT38O76015 456 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 EPN2O95208 641 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 TRIM16O95361 564 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 CFBP00751 764 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 CNPP09543 421 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 SPATA31D3P0C874 917 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 RAP1GAPP47736 663 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 BCAR1P56945 870 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 IGBP1P78318 339 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 KRT76Q01546 638 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 PPFIA1Q13136 1202 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 POLA2Q14181 598 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 GAS6Q14393 721 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 NEDD9Q14511 834 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 UBE3CQ15386 1083 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 GRIK4Q16099 956 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 UAP1L1Q3KQV9 507 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 ALDH1L2Q3SY69 923 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 ODR4Q5SWX8 454 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 MARCH8Q5T0T0 291 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 TCEAL6Q6IPX3 200 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 METTL7BQ6UX53 244 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 AACSQ86V21 672 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 KBTBD6Q86V97 674 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 TRIM50Q86XT4 487 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 ABI1Q8IZP0 508 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF687Q8N1G0 1237 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 LRRC43Q8N309 656 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 NME8Q8N427 588 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF843Q8N446 348 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 DEFB124Q8NES8 71 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 SPATA18Q8TC71 538 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 SSH3Q8TE77 659 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 PHKBQ93100 1093 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 TCEAL3Q969E4 200 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 ZBTB10Q96DT7 871 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 IGSF21Q96ID5 467 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 PDCD2LQ9BRP1 358 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 IER2Q9BTL4 223 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 NT5C3AQ9H0P0 336 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 SLC32A1Q9H598 525 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 CDHR5Q9HBB8 845 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 SCUBE2Q9NQ36 999 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 MAN1C1Q9NR34 630 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 PXMP2Q9NR77 195 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 VPS45Q9NRW7 570 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 RNF19AQ9NV58 838 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 TUBE1Q9UJT0 475 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 CDH7Q9ULB5 785 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 GINS2Q9Y248 185 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 RAXQ9Y2V3 346 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 TELO2Q9Y4R8 837 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 FREM2Q5SZK8 3169 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 SPAG17Q6Q759 2223 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 DOCK6Q96HP0 2047 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 GREB1Q4ZG55 1949 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 KALRNO60229 2985 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 COL4A3Q01955 1670 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 TEX15Q9BXT5 2789 aa2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms