RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579358.1

MKS1-208, Transcript of Meckel syndrome, type 1, human

TSL 4

Gene MKS1, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKS1-208	ENST00000579358	PPP2R5A	Q15172	486 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	KIFAP3	Q92845	792 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	CLIC6	Q96NY7	704 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	RAD9A	Q99638	391 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	CHST12	Q9NRB3	414 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	RGS18	Q9NS28	235 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	SI	P14410	1827 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	COL4A6	Q14031	1691 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	DENND3	A2RUS2	1198 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358		C9IYK1	514 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	CUTA	O60888	179 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	PLA2G4B	P0C869	781 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	STAG3L1	P0CL83	205 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	PLCG1	P19174	1290 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	NAMPT	P43490	491 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	RABGGTB	P53611	331 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	SLC12A3	P55017	1021 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	KRT85	P78386	507 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	NUCB2	P80303	420 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	RAD54L	Q92698	747 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	EPSTI1	Q96J88	318 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	DRC1	Q96MC2	740 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	ADAM2	Q99965	735 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	DACT1	Q9NYF0	836 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	STK17A	Q9UEE5	414 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	INSL6	Q9Y581	213 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	KAT6A	Q92794	2004 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	FGFR4	P22455	802 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	AXL	P30530	894 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	SPECC1	Q5M775	1068 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	USP49	Q70CQ1	688 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	DAW1	Q8N136	415 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	IFT74	Q96LB3	600 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	PLIN2	Q99541	437 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	WDR81	Q562E7	1941 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	TET1	Q8NFU7	2136 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	ARID2	Q68CP9	1835 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358		A0A0U1RQF3	1178 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	HIP1R	O75146	1068 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	ERLIN2	O94905	339 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	11.1	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	CA3	P07451	260 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	SKI	P12755	728 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	RAB27A	P51159	221 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	FAM189B	P81408	668 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MKS1-208	ENST00000579358	MAPK7	Q13164	816 aa		11.1	□□□□□ -0.63

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