RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 KCTD17Q8N5Z5 321 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 GSDMBQ8TAX9 411 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 ERP44Q9BS26 406 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 PICK1Q9NRD5 415 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 STXBP3O00186 592 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 TDP2O95551 362 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 GSTA1P08263 222 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 ALAS1P13196 640 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 ITIH2P19823 946 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 KLRC1P26715 233 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 HSD17B3P37058 310 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 DLGAP5Q15398 846 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 TTI2Q6NXR4 508 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 CNPY4Q8N129 248 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 CARD9Q9H257 536 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 PI4KBQ9UBF8 816 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 CCPG1Q9ULG6 757 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 A0A0G2JND7 137 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 MYMKA6NI61 221 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 TCP11X1B4DZS4 312 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 H0Y3Z8 333 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 TOM1O60784 492 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM253P0C7T8 217 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 GALCP54803 685 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 ESRRGP62508 458 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 HERVK_113P62684 666 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 BASP1P80723 227 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 TROAPQ12815 778 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 LLGL1Q15334 1064 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 JDP2Q8WYK2 163 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 C8orf37Q96NL8 207 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 EFHD1Q9BUP0 239 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 ITSN1Q15811 1721 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 MROH1Q8NDA8 1641 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 MED7O43513 233 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 GRAPQ13588 217 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 ITIH4Q14624 930 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 SCYL2Q6P3W7 929 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 TRIM50Q86XT4 487 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 CEP95Q96GE4 821 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 OLFM3Q96PB7 478 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 NUP85Q9BW27 656 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 KIAA1586Q9HCI6 787 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 HESX1Q9UBX0 185 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 LRRC10BA6NIK2 292 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 SCNN1DP51172 638 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 STAT2P52630 851 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 ARL8AQ96BM9 186 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 TRAIPQ9BWF2 469 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 LACRTQ9GZZ8 138 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 TMBIM4Q9HC24 238 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 KBTBD4Q9NVX7 518 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM260Q9NX78 707 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 UVRAGQ9P2Y5 699 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 ESYT2A0FGR8 921 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 RTN2O75298 545 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 ARFIP2P53365 341 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 BSPRYQ5W0U4 402 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 ATL2Q8NHH9 583 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 AGPAT1Q99943 283 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 ADAM22Q9P0K1 906 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF233A6NK53 670 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 COPEO14579 308 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 SLC1A1P43005 524 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 SKOR1P84550 965 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 LRRC14Q15048 493 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 PDXDC2PQ6P474 469 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 JAMLQ86YT9 394 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 MAML1Q92585 1016 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 WDR91A4D1P6 747 aa11.08□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 LRRIQ4A6NIV6 560 aa11.08□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 CREB3O43889 395 aa11.08□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 DIAPH2O60879 1101 aa11.08□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 KRT38O76015 456 aa11.08□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 VAMP7P51809 220 aa11.08□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 PRELPP51888 382 aa11.08□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 NXNQ6DKJ4 435 aa11.08□□□□□ -0.63
PTPRM-205ENST00000577827 TRIM72Q6ZMU5 477 aa11.08□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms