RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577667.1

PPP4R1-205, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 1, human

TSL 4

Gene PPP4R1, Length 560 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4R1-205	ENST00000577667	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	DYDC2	Q96IM9	177 aa		5	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	DRC1	Q96MC2	740 aa		5	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		5	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		5	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	CYP27B1	O15528	508 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	BCAR1	P56945	870 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	CRHR2	Q13324	411 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	MYBPC3	Q14896	1274 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	C7orf31	Q8N865	590 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	WDR92	Q96MX6	357 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	GPHA2	Q96T91	129 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	TOMM22	Q9NS69	142 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	DNAI1	Q9UI46	699 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	ADAM8	P78325	824 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	FHL2	Q14192	279 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	GAREM2	Q75VX8	874 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	CLEC14A	Q86T13	490 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	PIF1	Q9H611	641 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	OXSM	Q9NWU1	459 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	KPNA6	O60684	536 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	TOX4	O94842	621 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	APOL3	O95236	402 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	MCM7	P33993	719 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	ADCY2	Q08462	1091 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	ADCY1	Q08828	1119 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	TUBA3C	Q13748	450 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	TCEA2	Q15560	299 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	KRT40	Q6A162	431 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	MYL10	Q9BUA6	226 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	POFUT1	Q9H488	388 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	MTG2	Q9H4K7	406 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	IL23A	Q9NPF7	189 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	CEP72	Q9P209	647 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP4R1-205	ENST00000577667	UBE2QL1	A1L167	161 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	MAFG	O15525	162 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	GAS7	O60861	476 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	NEK4	P51957	841 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	HOMER1	Q86YM7	354 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	MIEF2	Q96C03	454 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	TCF25	Q9BQ70	676 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	ZMAT4	Q9H898	229 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	WIZ	O95785	1651 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	CFTR	P13569	1480 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	ARAP1	Q96P48	1450 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667		A0A0A6YYJ9	748 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	DAPK3	O43293	454 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	OPHN1	O60890	802 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	F2	P00734	622 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62

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