RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 CCDC169A6NNP5 214 aa21.14■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 ASAP2O43150 1006 aa21.14■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 NPTX2P47972 431 aa21.14■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 SMTNP53814 917 aa21.14■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa21.14■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 STX1AQ16623 288 aa21.14■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 KIAA0895Q8NCT3 520 aa21.14■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 FIZ1Q96SL8 496 aa21.14■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 KMT5AQ9NQR1 393 aa21.14■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 KCNG1Q9UIX4 513 aa21.14■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 H0YGN5 161 aa21.14■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 VTNP04004 478 aa21.14■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 MAPTP10636 758 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 NMT1P30419 496 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 NAMPTP43490 491 aa21.14■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 CAPSQ13938 189 aa21.14■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 TAF2Q6P1X5 1199 aa21.14■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 LRSAM1Q6UWE0 723 aa21.14■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 KSR1Q8IVT5 923 aa21.14■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 DNAJB3Q8WWF6 145 aa21.14■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 SPIRE2Q8WWL2 714 aa21.14■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa21.14■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 ANO10Q9NW15 660 aa21.14■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 NOD1Q9Y239 953 aa21.14■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa21.13■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 TANC1Q9C0D5 1861 aa21.13■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 LRRIQ4A6NIV6 560 aa21.13■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 K7ENM7 598 aa21.13■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 SLC16A4O15374 487 aa21.13■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 GCNT3O95395 438 aa21.13■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 COL6A1P12109 1028 aa21.13■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 CDK7P50613 346 aa21.13■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 NCKAP1LP55160 1127 aa21.13■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 ZNF445P59923 1031 aa21.13■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 DPCR1Q3MIW9 517 aa21.13■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 ZNF720Q7Z2F6 126 aa21.13■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 SERINC5Q86VE9 423 aa21.13■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 SLC17A8Q8NDX2 589 aa21.13■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 GLIS3Q8NEA6 775 aa21.13■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 SCN5AQ14524 2016 aa21.13■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa21.12■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 CASP5P51878 434 aa21.12■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 TFDP1Q14186 410 aa21.12■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa21.12■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 RNF149Q8NC42 400 aa21.12■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 NLRP4Q96MN2 994 aa21.12■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 CTAGE1Q96RT6 745 aa21.12■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 KIFC3Q9BVG8 833 aa21.12■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 TRIP11Q15643 1979 aa21.12■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 B4GALT4O60513 344 aa21.11■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 MYBP10242 640 aa21.11■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 PRCPP42785 496 aa21.11■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 HAUS6Q7Z4H7 955 aa21.11■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 NME8Q8N427 588 aa21.11■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 MLKLQ8NB16 471 aa21.11■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 DEPTORQ8TB45 409 aa21.11■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 DPF3Q92784 378 aa21.11■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 PPP1R16BQ96T49 567 aa21.11■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 C11orf49Q9H6J7 331 aa21.11■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa21.11■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa21.11■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 GPC3P51654 580 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 CDC42EP1Q00587 391 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 TMEM62Q0P6H9 643 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 PTK7Q13308 1070 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 STIM1Q13586 685 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 RSPH3Q86UC2 560 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 TRPV6Q9H1D0 765 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 SZT2Q5T011 3432 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 MROH7Q68CQ1 1323 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 CITO14578 2027 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 A0A087WZ62 844 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 H0YCG3 227 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 CD44P16070 742 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 ALCAMQ13740 583 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 ANO6Q4KMQ2 910 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 COBLL1Q53SF7 1204 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 NECAB2Q7Z6G3 386 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 FAM126BQ8IXS8 530 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 MYOCDQ8IZQ8 938 aa21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms