RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548465.1

TPCN1-211, Transcript of two pore segment channel 1, humanhuman

TSL 3

Gene TPCN1, Length 593 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1-211ENST00000548465 GLRA2P23416 452 aa14.73□□□□□ -0.05
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TPCN1-211ENST00000548465 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
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TPCN1-211ENST00000548465 SLC17A8Q8NDX2 589 aa14.69□□□□□ -0.06
TPCN1-211ENST00000548465 LRRC15Q8TF66 581 aa14.69□□□□□ -0.06
TPCN1-211ENST00000548465 LPPQ93052 612 aa14.69□□□□□ -0.06
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TPCN1-211ENST00000548465 CASD1Q96PB1 797 aa14.69□□□□□ -0.06
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TPCN1-211ENST00000548465 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
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