RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547701.5

CTDSP2-203, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-203ENST00000547701 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa25.9■■□□□ 1.74
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CTDSP2-203ENST00000547701 LPXNO60711 386 aa25.9■■□□□ 1.74
CTDSP2-203ENST00000547701 TMEM143Q96AN5 459 aa25.9■■□□□ 1.74
CTDSP2-203ENST00000547701 AK8Q96MA6 479 aa25.9■■□□□ 1.74
CTDSP2-203ENST00000547701 EPOPA6NHQ4 379 aa25.89■■□□□ 1.74
CTDSP2-203ENST00000547701 EOMESO95936 686 aa25.89■■□□□ 1.74
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CTDSP2-203ENST00000547701 PTENP60484 403 aa25.89■■□□□ 1.74
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CTDSP2-203ENST00000547701 KRT79Q5XKE5 535 aa25.89■■□□□ 1.74
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CTDSP2-203ENST00000547701 FIBCD1Q8N539 461 aa25.89■■□□□ 1.74
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CTDSP2-203ENST00000547701 MTMR6Q9Y217 621 aa25.89■■□□□ 1.74
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CTDSP2-203ENST00000547701 ZNF623O75123 536 aa25.88■■□□□ 1.73
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CTDSP2-203ENST00000547701 SCLT1Q96NL6 688 aa25.88■■□□□ 1.73
CTDSP2-203ENST00000547701 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
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CTDSP2-203ENST00000547701 TFDP1Q14186 410 aa25.87■■□□□ 1.73
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CTDSP2-203ENST00000547701 H3BNC9 293 aa25.86■■□□□ 1.73
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CTDSP2-203ENST00000547701 SKIP12755 728 aa25.86■■□□□ 1.73
CTDSP2-203ENST00000547701 PHKA2P46019 1235 aa25.86■■□□□ 1.73
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CTDSP2-203ENST00000547701 ECHDC2Q86YB7 292 aa25.86■■□□□ 1.73
CTDSP2-203ENST00000547701 TMEM192Q8IY95 271 aa25.86■■□□□ 1.73
CTDSP2-203ENST00000547701 RNF149Q8NC42 400 aa25.86■■□□□ 1.73
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CTDSP2-203ENST00000547701 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa25.86■■□□□ 1.73
CTDSP2-203ENST00000547701 LRFN2Q9ULH4 789 aa25.86■■□□□ 1.73
CTDSP2-203ENST00000547701 KIAA1024Q9UPX6 916 aa25.86■■□□□ 1.73
CTDSP2-203ENST00000547701 MTCH2Q9Y6C9 303 aa25.86■■□□□ 1.73
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CTDSP2-203ENST00000547701 CERS4Q9HA82 394 aa25.84■■□□□ 1.73
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CTDSP2-203ENST00000547701 TMEM117Q9H0C3 514 aa25.83■■□□□ 1.73
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CTDSP2-203ENST00000547701 TIPINQ9BVW5 301 aa25.82■■□□□ 1.72
CTDSP2-203ENST00000547701 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
CTDSP2-203ENST00000547701 KIAA1671Q9BY89 1806 aa25.81■■□□□ 1.72
CTDSP2-203ENST00000547701 PP2D1A8MPX8 630 aa25.81■■□□□ 1.72
CTDSP2-203ENST00000547701 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa25.81■■□□□ 1.72
CTDSP2-203ENST00000547701 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
CTDSP2-203ENST00000547701 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
CTDSP2-203ENST00000547701 LMAN2LQ9H0V9 348 aa25.81■■□□□ 1.72
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