RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 DARSP14868 501 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 LAG3P18627 525 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 SCP2P22307 547 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 ABCD1P33897 745 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 CTNNB1P35222 781 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 BMPR1AP36894 532 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 PRPHP41219 470 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 CLCN3P51790 818 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 FOSBP53539 338 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 HIC1Q14526 733 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 MBTPS1Q14703 1052 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP2R5AQ15172 486 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 NPY5RQ15761 445 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM132AQ24JP5 1023 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 B3GNT9Q6UX72 402 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 CATSPER4Q7RTX7 472 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 LRRC71Q8N4P6 559 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 URGCPQ8TCY9 931 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 OXER1Q8TDS5 423 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 HAS1Q92839 578 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 P2RX5Q93086 422 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 WNT8BQ93098 351 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 HLA-CQ95604 372 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC51Q96ER9 411 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 IFT74Q96LB3 600 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 UIMC1Q96RL1 719 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 TIPINQ9BVW5 301 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 RGS18Q9NS28 235 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM161AQ9NX61 479 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 LRWD1Q9UFC0 647 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 DNM3Q9UQ16 869 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 CHD8Q9HCK8 2581 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A0U1RQF3 1178 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 TBKBP1A7MCY6 615 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 ZBTB42B2RXF5 422 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 C5orf67F2Z3F1 127 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 H0YCG3 227 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 H3BNC9 293 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF862O60290 1169 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 GPR32O75388 356 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 DGKIO75912 1065 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 LARGE1O95461 756 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 MYOGP15173 224 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 ATP4AP20648 1035 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 RPA1P27694 616 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 GJB2P29033 226 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 TXLNAP40222 546 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 TECP42680 631 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 GPC3P51654 580 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 EFNA5P52803 228 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 PTPN5P54829 565 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 CYP4A11Q02928 519 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 UBE3AQ05086 875 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 GPM6BQ13491 265 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 GIT2Q14161 759 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 GPNMBQ14956 572 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 EMC2Q15006 297 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF174Q15697 407 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 EPC2Q52LR7 807 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 NOTUMQ6P988 496 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP6.23□□□□□ -1.41
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CLSTN3-215ENST00000544584 HSCBQ8IWL3 235 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM178BQ8IXR5 827 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 THNSL1Q8IYQ7 743 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 GJD3Q8N144 294 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 LRRC43Q8N309 656 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 PRSS33Q8NF86 280 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 RASSF8Q8NHQ8 419 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 KIFAP3Q92845 792 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 TNFRSF25Q93038 417 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 DYDC2Q96IM9 177 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 TMX3Q96JJ7 454 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 AK8Q96MA6 479 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 NLRP4Q96MN2 994 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 MTMR9Q96QG7 549 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 HSD17B14Q9BPX1 270 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 ADPGKQ9BRR6 497 aa6.23□□□□□ -1.41
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