RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	ARL2	P36404	184 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	PPP1R2	P41236	205 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	PHKA2	P46019	1235 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF131	P52739	623 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	ADAM17	P78536	824 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	MAPK7	Q13164	816 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	ALCAM	Q13740	583 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	STX1A	Q16623	288 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	ISM2	Q6H9L7	571 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	SERINC5	Q86VE9	423 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	NME8	Q8N427	588 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	RNF149	Q8NC42	400 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	B4GALT4	O60513	344 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	SCP2	P22307	547 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	GLRA2	P23416	452 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	STRN3	Q13033	797 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	DRP2	Q13474	957 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	CAPS	Q13938	189 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF410	Q86VK4	478 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	DAW1	Q8N136	415 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	SPATA20	Q8TB22	786 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	ABHD8	Q96I13	439 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	ANO10	Q9NW15	660 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	GINS2	Q9Y248	185 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	ALPK3	Q96L96	1907 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	UBE4B	O95155	1302 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	13.1	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	SLC16A4	O15374	487 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	CAND2	O75155	1236 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	COL6A1	P12109	1028 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	THPO	P40225	353 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	NPTX2	P47972	431 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	CDK7	P50613	346 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	GPC3	P51654	580 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	NCKAP1L	P55160	1127 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	NLRP12	P59046	1061 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	BFSP2	Q13515	415 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	MORC3	Q14149	939 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	HIC1	Q14526	733 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	TRIM60	Q495X7	471 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	TNS4	Q8IZW8	715 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	CAGE1	Q8TC20	777 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	BSND	Q8WZ55	320 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	HVCN1	Q96D96	273 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	GDA	Q9Y2T3	454 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658		A0A087WZ62	844 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	DENND3	A2RUS2	1198 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658		K7ERI5	159 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	PSMA7	O14818	248 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	ERLIN2	O94905	339 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	CTSH	P09668	335 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	EFNA5	P52803	228 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	POU5F1B	Q06416	359 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	TYRO3	Q06418	890 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	KSR1	Q8IVT5	923 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDB1-223	ENST00000543658	MLKL	Q8NB16	471 aa		13.09	□□□□□ -0.31

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