RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543123.1

RTN3-212, Transcript of reticulon 3, humanhuman

TSL 2

Gene RTN3, Length 712 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN3-212ENST00000543123 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RTN3-212ENST00000543123 VAV3Q9UKW4 847 aa14.71□□□□□ -0.05
RTN3-212ENST00000543123 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RTN3-212ENST00000543123 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa14.7□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 C19orf67A6NJJ6 358 aa14.7□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 LINC01565O15544 149 aa14.7□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 GAS2O43903 313 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 EYA4O95677 639 aa14.7□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 P4HBP07237 508 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.063e-7■■■■■ 29.2
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RTN3-212ENST00000543123 RAB27AP51159 221 aa14.7□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 AK2P54819 239 aa14.7□□□□□ -0.06
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RTN3-212ENST00000543123 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
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RTN3-212ENST00000543123 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa14.7□□□□□ -0.06
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RTN3-212ENST00000543123 SMRP1Q8NCR6 262 aa14.7□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.062e-6■■□□□ 11.6
RTN3-212ENST00000543123 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 MSLNLQ96KJ4 702 aa14.7□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 CASD1Q96PB1 797 aa14.7□□□□□ -0.06
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RTN3-212ENST00000543123 CWH43Q9H720 699 aa14.7□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa14.7□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 CYP26B1Q9NR63 512 aa14.7□□□□□ -0.06
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RTN3-212ENST00000543123 DRP2Q13474 957 aa14.69□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 TRIM29Q14134 588 aa14.69□□□□□ -0.06
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RTN3-212ENST00000543123 CATSPER4Q7RTX7 472 aa14.69□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 GTF3C6Q969F1 213 aa14.69□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 FAM122AQ96E09 287 aa14.69□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 CEP170P1Q96L14 293 aa14.69□□□□□ -0.06
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RTN3-212ENST00000543123 CEP89Q96ST8 783 aa14.69□□□□□ -0.06
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RTN3-212ENST00000543123 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa14.68□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 RNF19AQ9NV58 838 aa14.68□□□□□ -0.06
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RTN3-212ENST00000543123 HCSTQ9UBK5 93 aa14.68□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa14.68□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 GLP2RO95838 553 aa14.67□□□□□ -0.06
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RTN3-212ENST00000543123 PGBD4Q96DM1 585 aa14.67□□□□□ -0.06
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RTN3-212ENST00000543123 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 CTDNEP1O95476 244 aa14.66□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa14.66□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 SLC39A11Q8N1S5 342 aa14.66□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 HAS1Q92839 578 aa14.66□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 TMEM169Q96HH4 297 aa14.66□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 GJB4Q9NTQ9 266 aa14.66□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa14.66□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 FAM105AQ9NUU6 356 aa14.66□□□□□ -0.06
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