RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540501.1

STIP1-208, Transcript of stress induced phosphoprotein 1, humanhuman

TSL 3

Gene STIP1, Length 880 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STIP1-208ENST00000540501 RSPH10BP0C881 870 aa28.39■■■□□ 2.14
STIP1-208ENST00000540501 GLRA2P23416 452 aa28.39■■■□□ 2.14
STIP1-208ENST00000540501 TLE2Q04725 743 aa28.39■■■□□ 2.14
STIP1-208ENST00000540501 RBL2Q08999 1139 aa28.39■■■□□ 2.14
STIP1-208ENST00000540501 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa28.39■■■□□ 2.14
STIP1-208ENST00000540501 COASYQ13057 564 aa28.39■■■□□ 2.14
STIP1-208ENST00000540501 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
STIP1-208ENST00000540501 CTAGE1Q96RT6 745 aa28.39■■■□□ 2.14
STIP1-208ENST00000540501 HTATIP2Q9BUP3 242 aa28.39■■■□□ 2.14
STIP1-208ENST00000540501 C2orf40Q9H1Z8 148 aa28.39■■■□□ 2.14
STIP1-208ENST00000540501 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa28.39■■■□□ 2.14
STIP1-208ENST00000540501 KLRC4O43908 158 aa28.38■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 RHOBTB3O94955 611 aa28.38■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 CASP1P29466 404 aa28.38■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 SARSP49591 514 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 PEX3P56589 373 aa28.38■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 DRP2Q13474 957 aa28.38■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 ALCAMQ13740 583 aa28.38■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa28.38■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 FAM178BQ8IXR5 827 aa28.38■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 TRIML1Q8N9V2 468 aa28.38■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 NFKBIZQ9BYH8 718 aa28.38■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 SFI1A8K8P3 1242 aa28.37■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 GPC3P51654 580 aa28.37■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 SOX10P56693 466 aa28.37■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 LRRC26Q2I0M4 334 aa28.37■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 KMT5BQ4FZB7 885 aa28.37■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 ASAP3Q8TDY4 903 aa28.37■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 KCNN1Q92952 543 aa28.37■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 ZBTB10Q96DT7 871 aa28.37■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 KMT5AQ9NQR1 393 aa28.37■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 TMEM63CQ9P1W3 806 aa28.37■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 CCDC169A6NNP5 214 aa28.36■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 PITPNM1O00562 1244 aa28.36■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 VTNP04004 478 aa28.36■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 THPOP40225 353 aa28.36■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 PHKA2P46019 1235 aa28.36■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 EFNA5P52803 228 aa28.36■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 EHHADHQ08426 723 aa28.36■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 FAM26FQ5R3K3 315 aa28.36■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 SFR1Q86XK3 245 aa28.36■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa28.36■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 RNF149Q8NC42 400 aa28.36■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 DEPTORQ8TB45 409 aa28.36■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 SCLT1Q96NL6 688 aa28.36■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa28.36■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 TRPV2Q9Y5S1 764 aa28.36■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 LRRIQ4A6NIV6 560 aa28.35■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 KIF20AO95235 890 aa28.35■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 PARNO95453 639 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 CLTBP09497 229 aa28.35■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 NPTX2P47972 431 aa28.35■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 CAPSQ13938 189 aa28.35■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP28.35■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 FAM26DQ5JW98 314 aa28.35■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa28.35■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 NLRP7Q8WX94 980 aa28.35■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 POLD4Q9HCU8 107 aa28.35■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa28.35■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 SQORQ9Y6N5 450 aa28.35■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 BRCA2P51587 3418 aa28.34■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa28.34■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 NCKAP1LP55160 1127 aa28.34■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 PTENP60484 403 aa28.34■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 FAAP100Q0VG06 881 aa28.34■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 HVCN1Q96D96 273 aa28.34■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 NLRP4Q96MN2 994 aa28.34■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 PCDH10Q9P2E7 1040 aa28.34■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 GPR32O75388 356 aa28.33■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 PPP1R2P41236 205 aa28.33■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 BSNDQ8WZ55 320 aa28.33■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 ADAMTS10Q9H324 1103 aa28.33■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 TMEM134Q9H6X4 195 aa28.33■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 TMEM39AQ9NV64 488 aa28.33■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa28.33■■■□□ 2.13
STIP1-208ENST00000540501 CKBP12277 381 aa28.32■■■□□ 2.12
STIP1-208ENST00000540501 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
STIP1-208ENST00000540501 ZNF720Q7Z2F6 126 aa28.32■■■□□ 2.12
STIP1-208ENST00000540501 USP38Q8NB14 1042 aa28.32■■■□□ 2.12
STIP1-208ENST00000540501 MAN1B1Q9UKM7 699 aa28.32■■■□□ 2.12
STIP1-208ENST00000540501 CDY2AQ9Y6F7 541 aa28.32■■■□□ 2.12
STIP1-208ENST00000540501 A0A087WZ62 844 aa28.31■■■□□ 2.12
STIP1-208ENST00000540501 K7ENM7 598 aa28.31■■■□□ 2.12
STIP1-208ENST00000540501 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP28.31■■■□□ 2.12
STIP1-208ENST00000540501 SELPP16109 830 aa28.31■■■□□ 2.12
STIP1-208ENST00000540501 KIZQ2M2Z5 673 aa28.31■■■□□ 2.12
STIP1-208ENST00000540501 SASS6Q6UVJ0 657 aa28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms