RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 SERPING1P05155 500 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 ANO5Q75V66 913 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 TXLNBQ8N3L3 684 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 BACH1O14867 736 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 HIP1RO75146 1068 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 ATG7O95352 703 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC10A3P09131 477 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 NPEPPSP55786 919 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 AMPD2Q01433 879 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 LY6KQ17RY6 165 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 HGSNATQ68CP4 663 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 PLA2G4FQ68DD2 849 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 PLCB1Q9NQ66 1216 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 PSAPP07602 524 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 GPR142Q7Z601 462 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 CPA4Q9UI42 421 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa22.14■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 CASP4P49662 377 aa22.14■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 EXOC3L4Q17RC7 722 aa22.14■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 TCERG1LQ5VWI1 586 aa22.14■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.14■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 GANQ9H2C0 597 aa22.14■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 TGFB3P10600 412 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 CLCN6P51797 869 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 MKNK1Q9BUB5 465 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 GBP3Q9H0R5 595 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 DUSP10Q9Y6W6 482 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 MACROD2A1Z1Q3 448 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 STRNO43815 780 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP4AP20648 1035 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 MAGEA1P43355 309 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 MAEAQ7L5Y9 396 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM186BQ8IYM0 893 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC35C1Q96A29 364 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 PDGFCQ9NRA1 345 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 AIPL1Q9NZN9 384 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 TLR2O60603 784 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 GGPS1O95749 300 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 RAPGEF1Q13905 1077 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 GRB14Q14449 540 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 XKR9Q5GH70 373 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 GBP6Q6ZN66 633 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 ARMCX2Q7L311 632 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 BORCS6Q96GS4 357 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 ZIC5Q96T25 663 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 PCYT2Q99447 389 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 OGFRQ9NZT2 677 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 ANO9A1A5B4 782 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 CTAGE15A4D2H0 777 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 CTAGE8P0CG41 777 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 MAPTP10636 758 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 PON1P27169 355 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 APBA1Q02410 837 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 ALCAMQ13740 583 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 NEDD9Q14511 834 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 CTAGE6Q86UF2 777 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 CTAGE4Q8IX94 777 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM58Q8NG06 486 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 STRA6Q9BX79 667 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 SAR1BQ9Y6B6 198 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 ASB14A6NK59 587 aa22.11■■□□□ 1.13
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