RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	STK25	O00506	426 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	13.8	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	KIF5B	P33176	963 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	SLC11A1	P49279	550 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	DRP2	Q13474	957 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	LETM2	Q2VYF4	491 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	RUBCN	Q92622	972 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	ANO3	Q9BYT9	981 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	COL4A3	Q01955	1670 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF862	O60290	1169 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	GPC3	P51654	580 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	GPR152	Q8TDT2	470 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	AKT3	Q9Y243	479 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	CHD6	Q8TD26	2715 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	PRC1	O43663	620 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	OFD1	O75665	1012 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	DDHD2	O94830	711 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	SREBF1	P36956	1147 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	GNAQ	P50148	359 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	FUT2	Q10981	343 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	HINFP	Q9BQA5	517 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	FOXQ1	Q9C009	403 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-222	ENST00000533557	EDIL3	O43854	480 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	RFPL2	O75678	378 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	CHML	P26374	656 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	KLRC2	P26717	231 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	PHKA2	P46019	1235 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	USP24	Q9UPU5	2620 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	SRF	P11831	508 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	TGM1	P22735	817 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	GIT2	Q14161	759 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	UGCG	Q16739	394 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	FANCB	Q8NB91	859 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	MAP4K1	Q92918	833 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	GBP3	Q9H0R5	595 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	MAGEB2	O15479	319 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	SPATA31D3	P0C874	917 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	NAPA	P54920	295 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	CEP89	Q96ST8	783 aa		13.75	□□□□□ -0.21

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