RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 PHKA2P46019 1235 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRK-222ENST00000532751 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
PTPRK-222ENST00000532751 GRIN2CQ14957 1233 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRK-222ENST00000532751 HYIQ5T013 277 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRK-222ENST00000532751 SLC24A5Q71RS6 500 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRK-222ENST00000532751 MAEAQ7L5Y9 396 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRK-222ENST00000532751 CATSPER4Q7RTX7 472 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRK-222ENST00000532751 CALML4Q96GE6 196 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRK-222ENST00000532751 GUCD1Q96NT3 240 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRK-222ENST00000532751 USP28Q96RU2 1077 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRK-222ENST00000532751 IFT122Q9HBG6 1241 aa24.38■■□□□ 1.49
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PTPRK-222ENST00000532751 E9PMD0 336 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRK-222ENST00000532751 F13A1P00488 732 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRK-222ENST00000532751 TAP1Q03518 808 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRK-222ENST00000532751 DSC3Q14574 896 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRK-222ENST00000532751 FAM102BQ5T8I3 360 aa24.37■■□□□ 1.49
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PTPRK-222ENST00000532751 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PTPRK-222ENST00000532751 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PTPRK-222ENST00000532751 CHST12Q9NRB3 414 aa24.37■■□□□ 1.49
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PTPRK-222ENST00000532751 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa24.37■■□□□ 1.49
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PTPRK-222ENST00000532751 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
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PTPRK-222ENST00000532751 COL4A6Q14031 1691 aa24.36■■□□□ 1.49
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PTPRK-222ENST00000532751 CAPSQ13938 189 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRK-222ENST00000532751 STK38Q15208 465 aa24.35■■□□□ 1.49
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PTPRK-222ENST00000532751 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
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PTPRK-222ENST00000532751 SLC39A14Q15043 492 aa24.34■■□□□ 1.49
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PTPRK-222ENST00000532751 PLIN2Q99541 437 aa24.34■■□□□ 1.49
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PTPRK-222ENST00000532751 TMEM119Q4V9L6 283 aa24.33■■□□□ 1.49
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PTPRK-222ENST00000532751 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
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PTPRK-222ENST00000532751 CSRNP2Q9H175 543 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRK-222ENST00000532751 CERS4Q9HA82 394 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM161AQ9NX61 479 aa24.33■■□□□ 1.49
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PTPRK-222ENST00000532751 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
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PTPRK-222ENST00000532751 IFT74Q96LB3 600 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRK-222ENST00000532751 SAMD11Q96NU1 681 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRK-222ENST00000532751 CCSER1Q9C0I3 900 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRK-222ENST00000532751 MINDY3Q9H8M7 445 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRK-222ENST00000532751 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
PTPRK-222ENST00000532751 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRK-222ENST00000532751 HOXA2O43364 376 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRK-222ENST00000532751 SKIP12755 728 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRK-222ENST00000532751 FOSL2P15408 326 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRK-222ENST00000532751 PKP1Q13835 747 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRK-222ENST00000532751 RINT1Q6NUQ1 792 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRK-222ENST00000532751 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
PTPRK-222ENST00000532751 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
PTPRK-222ENST00000532751 TIPINQ9BVW5 301 aa24.31■■□□□ 1.48
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