RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525711.1

UBASH3B-202, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-202ENST00000525711 PSAPP07602 524 aa16.06■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 ANAPC15P60006 121 aa16.06■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 FUT2Q10981 343 aa16.06■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 EFCAB12Q6NXP0 572 aa16.06■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 CCDC149Q6ZUS6 474 aa16.06■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 CABP7Q86V35 215 aa16.06■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 PPFIBP1Q86W92 1011 aa16.06■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF577Q9BSK1 485 aa16.06■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 SFXN1Q9H9B4 322 aa16.06■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 FBXL21Q9UKT6 434 aa16.06■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 SAMM50Q9Y512 469 aa16.06■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 SNX14Q9Y5W7 946 aa16.06■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 IRAK3Q9Y616 596 aa16.06■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa16.05■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 DHX15O43143 795 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 EPCAMP16422 314 aa16.05■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 TDGQ13569 410 aa16.05■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 ANGPT1Q15389 498 aa16.05■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 OTOP3Q7RTS5 596 aa16.05■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 CCDC105Q8IYK2 499 aa16.05■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 ADAMTS10Q9H324 1103 aa16.05■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 GABBR1Q9UBS5 961 aa16.05■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa16.05■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 DMXL1Q9Y485 3027 aa16.05■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 FANCMQ8IYD8 2048 aa16.04■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 FAM86B1E9PN63 330 aa16.04■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 FAM86B2P0C5J1 330 aa16.04■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 CTSAP10619 480 aa16.04■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 PSMA5P28066 241 aa16.04■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 CLK2P49760 499 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 GPC3P51654 580 aa16.04■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 ADCK5Q3MIX3 580 aa16.04■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 TMC5Q6UXY8 1006 aa16.04■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 LRRC71Q8N4P6 559 aa16.04■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 NLRP7Q8WX94 980 aa16.04■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 LRRC2Q9BYS8 371 aa16.04■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 BACH2Q9BYV9 841 aa16.04■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 TM6SF1Q9BZW5 370 aa16.04■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 BARHL2Q9NY43 387 aa16.04■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 DUSP12Q9UNI6 340 aa16.04■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF292O60281 2723 aa16.04■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa16.04■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa16.03■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 CYP3A4P08684 503 aa16.03■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 SKIP12755 728 aa16.03■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 DARSP14868 501 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 RFX1P22670 979 aa16.03■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 RTN1Q16799 776 aa16.03■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 APOA5Q6Q788 366 aa16.03■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 DTWD2Q8NBA8 298 aa16.03■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 KCNG4Q8TDN1 519 aa16.03■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 CRYGNQ8WXF5 182 aa16.03■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 AUTS2Q8WXX7 1259 aa16.03■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 SEMA4AQ9H3S1 761 aa16.03■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 NRBP2Q9NSY0 501 aa16.03■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 STK39Q9UEW8 545 aa16.03■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 MIA3Q5JRA6 1907 aa16.03■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 CACNA1AO00555 2505 aa16.02■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 OATP04181 439 aa16.02■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa16.02■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 KANK3Q6NY19 840 aa16.02■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 GPR149Q86SP6 731 aa16.02■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 SIX5Q8N196 739 aa16.02■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 FBXL16Q8N461 479 aa16.02■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 LINC01465Q8N7H1 131 aa16.02■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 SLC22A17Q8WUG5 538 aa16.02■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 IGSF21Q96ID5 467 aa16.02■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa16.02■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa16.02■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 CHST12Q9NRB3 414 aa16.02■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 IGSF9Q9P2J2 1179 aa16.02■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 V9GY48 417 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
UBASH3B-202ENST00000525711 WDR64B1ANS9 1081 aa16.01■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 STK25O00506 426 aa16.01■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 ZBTB43O43298 467 aa16.01■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 PI15O43692 258 aa16.01■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 NPR3P17342 541 aa16.01■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 PHKA2P46019 1235 aa16.01■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 CDC42EP1Q00587 391 aa16.01■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa16.01■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 GLB1LQ6UWU2 654 aa16.01■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 KCNK12Q9HB15 430 aa16.01■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 DNAH14Q0VDD8 3507 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms